Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CAVIN4Q5BKX8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CAVIN4Q5BKX8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CAVIN4Q5BKX8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CAVIN4Q5BKX8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CAVIN4Q5BKX8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAVIN4Q5BKX8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAVIN4Q5BKX8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAVIN4Q5BKX8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAVIN4Q5BKX8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAVIN4Q5BKX8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CAVIN4Q5BKX8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAVIN4Q5BKX8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAVIN4Q5BKX8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAVIN4Q5BKX8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAVIN4Q5BKX8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAVIN4Q5BKX8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CAVIN4Q5BKX8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAVIN4Q5BKX8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAVIN4Q5BKX8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAVIN4Q5BKX8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CAVIN4Q5BKX8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CAVIN4Q5BKX8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAVIN4Q5BKX8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAVIN4Q5BKX8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CAVIN4Q5BKX8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAVIN4Q5BKX8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAVIN4Q5BKX8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAVIN4Q5BKX8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAVIN4Q5BKX8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CAVIN4Q5BKX8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CAVIN4Q5BKX8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CAVIN4Q5BKX8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
CAVIN4Q5BKX8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CAVIN4Q5BKX8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CAVIN4Q5BKX8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CAVIN4Q5BKX8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
CAVIN4Q5BKX8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CAVIN4Q5BKX8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CAVIN4Q5BKX8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CAVIN4Q5BKX8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CAVIN4Q5BKX8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAVIN4Q5BKX8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAVIN4Q5BKX8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAVIN4Q5BKX8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAVIN4Q5BKX8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAVIN4Q5BKX8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CAVIN4Q5BKX8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAVIN4Q5BKX8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAVIN4Q5BKX8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAVIN4Q5BKX8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAVIN4Q5BKX8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAVIN4Q5BKX8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAVIN4Q5BKX8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAVIN4Q5BKX8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAVIN4Q5BKX8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAVIN4Q5BKX8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAVIN4Q5BKX8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAVIN4Q5BKX8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAVIN4Q5BKX8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAVIN4Q5BKX8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAVIN4Q5BKX8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAVIN4Q5BKX8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAVIN4Q5BKX8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAVIN4Q5BKX8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAVIN4Q5BKX8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAVIN4Q5BKX8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAVIN4Q5BKX8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAVIN4Q5BKX8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAVIN4Q5BKX8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAVIN4Q5BKX8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAVIN4Q5BKX8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAVIN4Q5BKX8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAVIN4Q5BKX8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAVIN4Q5BKX8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAVIN4Q5BKX8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAVIN4Q5BKX8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAVIN4Q5BKX8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAVIN4Q5BKX8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CAVIN4Q5BKX8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CAVIN4Q5BKX8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CAVIN4Q5BKX8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CAVIN4Q5BKX8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CAVIN4Q5BKX8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CAVIN4Q5BKX8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CAVIN4Q5BKX8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CAVIN4Q5BKX8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CAVIN4Q5BKX8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CAVIN4Q5BKX8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CAVIN4Q5BKX8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CAVIN4Q5BKX8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CAVIN4Q5BKX8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CAVIN4Q5BKX8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CAVIN4Q5BKX8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CAVIN4Q5BKX8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CAVIN4Q5BKX8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CAVIN4Q5BKX8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CAVIN4Q5BKX8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CAVIN4Q5BKX8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CAVIN4Q5BKX8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms