Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ODF2Q5BJF6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ODF2Q5BJF6 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ODF2Q5BJF6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ODF2Q5BJF6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ODF2Q5BJF6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ODF2Q5BJF6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms