Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COBLL1Q53SF7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COBLL1Q53SF7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COBLL1Q53SF7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COBLL1Q53SF7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COBLL1Q53SF7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COBLL1Q53SF7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COBLL1Q53SF7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COBLL1Q53SF7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COBLL1Q53SF7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COBLL1Q53SF7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COBLL1Q53SF7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COBLL1Q53SF7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COBLL1Q53SF7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COBLL1Q53SF7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COBLL1Q53SF7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COBLL1Q53SF7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COBLL1Q53SF7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COBLL1Q53SF7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
COBLL1Q53SF7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COBLL1Q53SF7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
COBLL1Q53SF7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COBLL1Q53SF7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COBLL1Q53SF7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COBLL1Q53SF7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COBLL1Q53SF7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COBLL1Q53SF7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COBLL1Q53SF7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COBLL1Q53SF7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COBLL1Q53SF7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COBLL1Q53SF7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COBLL1Q53SF7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COBLL1Q53SF7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COBLL1Q53SF7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COBLL1Q53SF7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COBLL1Q53SF7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COBLL1Q53SF7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COBLL1Q53SF7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
COBLL1Q53SF7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COBLL1Q53SF7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COBLL1Q53SF7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COBLL1Q53SF7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COBLL1Q53SF7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COBLL1Q53SF7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COBLL1Q53SF7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COBLL1Q53SF7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COBLL1Q53SF7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COBLL1Q53SF7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COBLL1Q53SF7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COBLL1Q53SF7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
COBLL1Q53SF7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COBLL1Q53SF7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COBLL1Q53SF7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COBLL1Q53SF7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COBLL1Q53SF7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COBLL1Q53SF7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COBLL1Q53SF7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COBLL1Q53SF7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
COBLL1Q53SF7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COBLL1Q53SF7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COBLL1Q53SF7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COBLL1Q53SF7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COBLL1Q53SF7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COBLL1Q53SF7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
COBLL1Q53SF7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COBLL1Q53SF7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COBLL1Q53SF7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COBLL1Q53SF7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COBLL1Q53SF7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COBLL1Q53SF7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COBLL1Q53SF7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COBLL1Q53SF7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COBLL1Q53SF7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
COBLL1Q53SF7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COBLL1Q53SF7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COBLL1Q53SF7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COBLL1Q53SF7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COBLL1Q53SF7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COBLL1Q53SF7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COBLL1Q53SF7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COBLL1Q53SF7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COBLL1Q53SF7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COBLL1Q53SF7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COBLL1Q53SF7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COBLL1Q53SF7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COBLL1Q53SF7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COBLL1Q53SF7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COBLL1Q53SF7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
COBLL1Q53SF7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
COBLL1Q53SF7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
COBLL1Q53SF7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COBLL1Q53SF7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COBLL1Q53SF7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COBLL1Q53SF7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COBLL1Q53SF7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COBLL1Q53SF7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms