Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALFQ53S48 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALFQ53S48 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALFQ53S48 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALFQ53S48 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALFQ53S48 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALFQ53S48 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALFQ53S48 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALFQ53S48 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALFQ53S48 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALFQ53S48 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALFQ53S48 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALFQ53S48 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ALFQ53S48 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALFQ53S48 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ALFQ53S48 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALFQ53S48 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALFQ53S48 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALFQ53S48 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALFQ53S48 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALFQ53S48 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ALFQ53S48 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALFQ53S48 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALFQ53S48 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALFQ53S48 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALFQ53S48 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALFQ53S48 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALFQ53S48 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALFQ53S48 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALFQ53S48 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALFQ53S48 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALFQ53S48 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALFQ53S48 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALFQ53S48 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALFQ53S48 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALFQ53S48 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ALFQ53S48 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALFQ53S48 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALFQ53S48 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ALFQ53S48 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALFQ53S48 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALFQ53S48 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALFQ53S48 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ALFQ53S48 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALFQ53S48 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ALFQ53S48 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALFQ53S48 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALFQ53S48 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALFQ53S48 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALFQ53S48 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALFQ53S48 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALFQ53S48 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ALFQ53S48 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALFQ53S48 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALFQ53S48 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALFQ53S48 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALFQ53S48 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ALFQ53S48 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALFQ53S48 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALFQ53S48 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALFQ53S48 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALFQ53S48 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALFQ53S48 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ALFQ53S48 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALFQ53S48 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALFQ53S48 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALFQ53S48 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALFQ53S48 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ALFQ53S48 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALFQ53S48 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALFQ53S48 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALFQ53S48 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALFQ53S48 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALFQ53S48 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALFQ53S48 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALFQ53S48 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALFQ53S48 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALFQ53S48 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALFQ53S48 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALFQ53S48 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALFQ53S48 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ALFQ53S48 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALFQ53S48 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ALFQ53S48 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALFQ53S48 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ALFQ53S48 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALFQ53S48 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALFQ53S48 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALFQ53S48 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALFQ53S48 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALFQ53S48 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALFQ53S48 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALFQ53S48 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALFQ53S48 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALFQ53S48 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALFQ53S48 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALFQ53S48 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALFQ53S48 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALFQ53S48 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALFQ53S48 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms