Protein–RNA interactions for Protein: Q52LW3

ARHGAP29, Rho GTPase-activating protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP29Q52LW3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARHGAP29Q52LW3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARHGAP29Q52LW3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARHGAP29Q52LW3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARHGAP29Q52LW3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP29Q52LW3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP29Q52LW3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP29Q52LW3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP29Q52LW3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP29Q52LW3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP29Q52LW3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP29Q52LW3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP29Q52LW3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP29Q52LW3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP29Q52LW3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP29Q52LW3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP29Q52LW3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP29Q52LW3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP29Q52LW3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP29Q52LW3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP29Q52LW3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP29Q52LW3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP29Q52LW3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP29Q52LW3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGAP29Q52LW3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGAP29Q52LW3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGAP29Q52LW3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGAP29Q52LW3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGAP29Q52LW3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGAP29Q52LW3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGAP29Q52LW3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGAP29Q52LW3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGAP29Q52LW3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGAP29Q52LW3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGAP29Q52LW3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGAP29Q52LW3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGAP29Q52LW3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGAP29Q52LW3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGAP29Q52LW3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGAP29Q52LW3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGAP29Q52LW3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms