Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTXN3Q4LDR2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTXN3Q4LDR2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTXN3Q4LDR2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTXN3Q4LDR2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTXN3Q4LDR2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTXN3Q4LDR2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTXN3Q4LDR2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTXN3Q4LDR2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTXN3Q4LDR2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTXN3Q4LDR2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTXN3Q4LDR2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTXN3Q4LDR2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTXN3Q4LDR2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CTXN3Q4LDR2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTXN3Q4LDR2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTXN3Q4LDR2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTXN3Q4LDR2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTXN3Q4LDR2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTXN3Q4LDR2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTXN3Q4LDR2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTXN3Q4LDR2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTXN3Q4LDR2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTXN3Q4LDR2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTXN3Q4LDR2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTXN3Q4LDR2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTXN3Q4LDR2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTXN3Q4LDR2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTXN3Q4LDR2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTXN3Q4LDR2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTXN3Q4LDR2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTXN3Q4LDR2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTXN3Q4LDR2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTXN3Q4LDR2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTXN3Q4LDR2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTXN3Q4LDR2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTXN3Q4LDR2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTXN3Q4LDR2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTXN3Q4LDR2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTXN3Q4LDR2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CTXN3Q4LDR2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTXN3Q4LDR2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTXN3Q4LDR2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTXN3Q4LDR2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTXN3Q4LDR2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTXN3Q4LDR2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTXN3Q4LDR2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTXN3Q4LDR2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTXN3Q4LDR2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTXN3Q4LDR2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTXN3Q4LDR2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTXN3Q4LDR2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CTXN3Q4LDR2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTXN3Q4LDR2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTXN3Q4LDR2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTXN3Q4LDR2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTXN3Q4LDR2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTXN3Q4LDR2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTXN3Q4LDR2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTXN3Q4LDR2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTXN3Q4LDR2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CTXN3Q4LDR2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTXN3Q4LDR2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTXN3Q4LDR2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTXN3Q4LDR2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTXN3Q4LDR2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTXN3Q4LDR2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTXN3Q4LDR2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTXN3Q4LDR2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTXN3Q4LDR2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTXN3Q4LDR2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTXN3Q4LDR2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTXN3Q4LDR2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTXN3Q4LDR2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTXN3Q4LDR2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTXN3Q4LDR2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTXN3Q4LDR2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTXN3Q4LDR2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTXN3Q4LDR2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTXN3Q4LDR2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTXN3Q4LDR2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTXN3Q4LDR2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTXN3Q4LDR2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTXN3Q4LDR2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTXN3Q4LDR2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CTXN3Q4LDR2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTXN3Q4LDR2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTXN3Q4LDR2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTXN3Q4LDR2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTXN3Q4LDR2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTXN3Q4LDR2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CTXN3Q4LDR2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTXN3Q4LDR2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTXN3Q4LDR2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTXN3Q4LDR2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTXN3Q4LDR2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTXN3Q4LDR2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTXN3Q4LDR2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTXN3Q4LDR2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTXN3Q4LDR2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms