Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0U5

CFAP221, Cilia- and flagella-associated protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP221Q4G0U5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CFAP221Q4G0U5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CFAP221Q4G0U5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CFAP221Q4G0U5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CFAP221Q4G0U5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CFAP221Q4G0U5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CFAP221Q4G0U5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CFAP221Q4G0U5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CFAP221Q4G0U5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CFAP221Q4G0U5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CFAP221Q4G0U5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CFAP221Q4G0U5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CFAP221Q4G0U5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CFAP221Q4G0U5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CFAP221Q4G0U5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CFAP221Q4G0U5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CFAP221Q4G0U5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CFAP221Q4G0U5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CFAP221Q4G0U5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CFAP221Q4G0U5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CFAP221Q4G0U5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CFAP221Q4G0U5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CFAP221Q4G0U5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CFAP221Q4G0U5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP221Q4G0U5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP221Q4G0U5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP221Q4G0U5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP221Q4G0U5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP221Q4G0U5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP221Q4G0U5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP221Q4G0U5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP221Q4G0U5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP221Q4G0U5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP221Q4G0U5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CFAP221Q4G0U5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CFAP221Q4G0U5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CFAP221Q4G0U5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CFAP221Q4G0U5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CFAP221Q4G0U5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CFAP221Q4G0U5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CFAP221Q4G0U5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CFAP221Q4G0U5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CFAP221Q4G0U5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CFAP221Q4G0U5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CFAP221Q4G0U5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CFAP221Q4G0U5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CFAP221Q4G0U5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CFAP221Q4G0U5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CFAP221Q4G0U5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CFAP221Q4G0U5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CFAP221Q4G0U5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CFAP221Q4G0U5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CFAP221Q4G0U5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CFAP221Q4G0U5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CFAP221Q4G0U5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CFAP221Q4G0U5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CFAP221Q4G0U5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CFAP221Q4G0U5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CFAP221Q4G0U5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CFAP221Q4G0U5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CFAP221Q4G0U5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CFAP221Q4G0U5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CFAP221Q4G0U5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CFAP221Q4G0U5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP221Q4G0U5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP221Q4G0U5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP221Q4G0U5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP221Q4G0U5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP221Q4G0U5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP221Q4G0U5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP221Q4G0U5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms