Protein–RNA interactions for Protein: Q32NC0

C18orf21, UPF0711 protein C18orf21, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf21Q32NC0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C18orf21Q32NC0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C18orf21Q32NC0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C18orf21Q32NC0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C18orf21Q32NC0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C18orf21Q32NC0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C18orf21Q32NC0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
C18orf21Q32NC0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C18orf21Q32NC0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C18orf21Q32NC0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C18orf21Q32NC0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C18orf21Q32NC0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C18orf21Q32NC0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms