Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKX8

ERCC6L, DNA excision repair protein ERCC-6-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6LQ2NKX8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ERCC6LQ2NKX8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC6LQ2NKX8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC6LQ2NKX8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC6LQ2NKX8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC6LQ2NKX8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC6LQ2NKX8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC6LQ2NKX8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC6LQ2NKX8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC6LQ2NKX8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC6LQ2NKX8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC6LQ2NKX8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC6LQ2NKX8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC6LQ2NKX8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC6LQ2NKX8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC6LQ2NKX8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC6LQ2NKX8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC6LQ2NKX8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC6LQ2NKX8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC6LQ2NKX8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC6LQ2NKX8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC6LQ2NKX8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC6LQ2NKX8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC6LQ2NKX8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC6LQ2NKX8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC6LQ2NKX8 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC6LQ2NKX8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC6LQ2NKX8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC6LQ2NKX8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC6LQ2NKX8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC6LQ2NKX8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC6LQ2NKX8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC6LQ2NKX8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC6LQ2NKX8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC6LQ2NKX8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERCC6LQ2NKX8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERCC6LQ2NKX8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERCC6LQ2NKX8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERCC6LQ2NKX8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERCC6LQ2NKX8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERCC6LQ2NKX8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERCC6LQ2NKX8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERCC6LQ2NKX8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERCC6LQ2NKX8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERCC6LQ2NKX8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERCC6LQ2NKX8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERCC6LQ2NKX8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERCC6LQ2NKX8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERCC6LQ2NKX8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ERCC6LQ2NKX8 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERCC6LQ2NKX8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERCC6LQ2NKX8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERCC6LQ2NKX8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERCC6LQ2NKX8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERCC6LQ2NKX8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERCC6LQ2NKX8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ERCC6LQ2NKX8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERCC6LQ2NKX8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ERCC6LQ2NKX8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERCC6LQ2NKX8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERCC6LQ2NKX8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERCC6LQ2NKX8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERCC6LQ2NKX8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERCC6LQ2NKX8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERCC6LQ2NKX8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERCC6LQ2NKX8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERCC6LQ2NKX8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERCC6LQ2NKX8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERCC6LQ2NKX8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERCC6LQ2NKX8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERCC6LQ2NKX8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERCC6LQ2NKX8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERCC6LQ2NKX8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERCC6LQ2NKX8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERCC6LQ2NKX8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ERCC6LQ2NKX8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERCC6LQ2NKX8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERCC6LQ2NKX8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC6LQ2NKX8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC6LQ2NKX8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC6LQ2NKX8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC6LQ2NKX8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC6LQ2NKX8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC6LQ2NKX8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC6LQ2NKX8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC6LQ2NKX8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC6LQ2NKX8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC6LQ2NKX8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERCC6LQ2NKX8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERCC6LQ2NKX8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ERCC6LQ2NKX8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERCC6LQ2NKX8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERCC6LQ2NKX8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERCC6LQ2NKX8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERCC6LQ2NKX8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERCC6LQ2NKX8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERCC6LQ2NKX8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERCC6LQ2NKX8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ERCC6LQ2NKX8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERCC6LQ2NKX8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms