Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ISXQ2M1V0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ISXQ2M1V0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms