Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC142Q17RM4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC142Q17RM4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC142Q17RM4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC142Q17RM4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC142Q17RM4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC142Q17RM4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC142Q17RM4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC142Q17RM4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC142Q17RM4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC142Q17RM4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC142Q17RM4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC142Q17RM4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC142Q17RM4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC142Q17RM4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC142Q17RM4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC142Q17RM4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC142Q17RM4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC142Q17RM4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC142Q17RM4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC142Q17RM4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC142Q17RM4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC142Q17RM4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC142Q17RM4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC142Q17RM4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC142Q17RM4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC142Q17RM4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC142Q17RM4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC142Q17RM4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC142Q17RM4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC142Q17RM4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC142Q17RM4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC142Q17RM4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC142Q17RM4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC142Q17RM4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC142Q17RM4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC142Q17RM4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC142Q17RM4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC142Q17RM4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC142Q17RM4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC142Q17RM4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC142Q17RM4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC142Q17RM4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC142Q17RM4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC142Q17RM4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC142Q17RM4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC142Q17RM4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC142Q17RM4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC142Q17RM4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC142Q17RM4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC142Q17RM4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC142Q17RM4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC142Q17RM4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC142Q17RM4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC142Q17RM4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms