Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UPP1Q16831 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UPP1Q16831 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UPP1Q16831 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UPP1Q16831 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UPP1Q16831 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UPP1Q16831 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UPP1Q16831 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UPP1Q16831 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UPP1Q16831 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UPP1Q16831 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UPP1Q16831 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UPP1Q16831 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UPP1Q16831 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UPP1Q16831 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UPP1Q16831 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UPP1Q16831 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UPP1Q16831 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UPP1Q16831 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UPP1Q16831 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UPP1Q16831 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UPP1Q16831 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UPP1Q16831 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UPP1Q16831 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UPP1Q16831 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UPP1Q16831 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UPP1Q16831 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UPP1Q16831 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UPP1Q16831 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UPP1Q16831 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UPP1Q16831 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UPP1Q16831 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UPP1Q16831 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UPP1Q16831 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UPP1Q16831 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UPP1Q16831 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UPP1Q16831 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UPP1Q16831 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UPP1Q16831 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UPP1Q16831 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
UPP1Q16831 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UPP1Q16831 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UPP1Q16831 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UPP1Q16831 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
UPP1Q16831 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UPP1Q16831 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UPP1Q16831 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
UPP1Q16831 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UPP1Q16831 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UPP1Q16831 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UPP1Q16831 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UPP1Q16831 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UPP1Q16831 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
UPP1Q16831 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
UPP1Q16831 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UPP1Q16831 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UPP1Q16831 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UPP1Q16831 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UPP1Q16831 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UPP1Q16831 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UPP1Q16831 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UPP1Q16831 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UPP1Q16831 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
UPP1Q16831 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UPP1Q16831 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UPP1Q16831 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UPP1Q16831 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UPP1Q16831 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UPP1Q16831 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
UPP1Q16831 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UPP1Q16831 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UPP1Q16831 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
UPP1Q16831 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UPP1Q16831 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
UPP1Q16831 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UPP1Q16831 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UPP1Q16831 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UPP1Q16831 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UPP1Q16831 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UPP1Q16831 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UPP1Q16831 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UPP1Q16831 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UPP1Q16831 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
UPP1Q16831 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
UPP1Q16831 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UPP1Q16831 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UPP1Q16831 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UPP1Q16831 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UPP1Q16831 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UPP1Q16831 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UPP1Q16831 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UPP1Q16831 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UPP1Q16831 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UPP1Q16831 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UPP1Q16831 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
UPP1Q16831 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UPP1Q16831 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UPP1Q16831 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UPP1Q16831 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UPP1Q16831 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms