Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDCD2Q16342 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
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