Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
VPS72Q15906 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
VPS72Q15906 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
VPS72Q15906 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
VPS72Q15906 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
VPS72Q15906 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
VPS72Q15906 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
VPS72Q15906 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
VPS72Q15906 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
VPS72Q15906 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
VPS72Q15906 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
VPS72Q15906 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
VPS72Q15906 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
VPS72Q15906 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
VPS72Q15906 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
VPS72Q15906 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
VPS72Q15906 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
VPS72Q15906 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
VPS72Q15906 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
VPS72Q15906 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
VPS72Q15906 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
VPS72Q15906 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
VPS72Q15906 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
VPS72Q15906 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
VPS72Q15906 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
VPS72Q15906 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
VPS72Q15906 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
VPS72Q15906 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
VPS72Q15906 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
VPS72Q15906 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
VPS72Q15906 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
VPS72Q15906 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
VPS72Q15906 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
VPS72Q15906 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
VPS72Q15906 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
VPS72Q15906 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
VPS72Q15906 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
VPS72Q15906 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
VPS72Q15906 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
VPS72Q15906 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
VPS72Q15906 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
VPS72Q15906 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
VPS72Q15906 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
VPS72Q15906 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
VPS72Q15906 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
VPS72Q15906 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
VPS72Q15906 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
VPS72Q15906 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
VPS72Q15906 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
VPS72Q15906 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
VPS72Q15906 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
VPS72Q15906 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
VPS72Q15906 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
VPS72Q15906 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
VPS72Q15906 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
VPS72Q15906 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
VPS72Q15906 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
VPS72Q15906 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
VPS72Q15906 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
VPS72Q15906 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
VPS72Q15906 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
VPS72Q15906 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
VPS72Q15906 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
VPS72Q15906 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
VPS72Q15906 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
VPS72Q15906 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
VPS72Q15906 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
VPS72Q15906 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
VPS72Q15906 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
VPS72Q15906 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
VPS72Q15906 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
VPS72Q15906 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
VPS72Q15906 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
VPS72Q15906 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
VPS72Q15906 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
VPS72Q15906 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
VPS72Q15906 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
VPS72Q15906 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
VPS72Q15906 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
VPS72Q15906 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
VPS72Q15906 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
VPS72Q15906 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
VPS72Q15906 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
VPS72Q15906 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
VPS72Q15906 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
VPS72Q15906 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
VPS72Q15906 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
VPS72Q15906 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
VPS72Q15906 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
VPS72Q15906 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
VPS72Q15906 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
VPS72Q15906 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
VPS72Q15906 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
VPS72Q15906 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
VPS72Q15906 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
VPS72Q15906 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
VPS72Q15906 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
VPS72Q15906 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
VPS72Q15906 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
VPS72Q15906 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
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