Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CHRNA2Q15822 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CHRNA2Q15822 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CHRNA2Q15822 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CHRNA2Q15822 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CHRNA2Q15822 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHRNA2Q15822 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHRNA2Q15822 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHRNA2Q15822 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHRNA2Q15822 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHRNA2Q15822 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHRNA2Q15822 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHRNA2Q15822 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHRNA2Q15822 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHRNA2Q15822 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHRNA2Q15822 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHRNA2Q15822 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHRNA2Q15822 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CHRNA2Q15822 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CHRNA2Q15822 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CHRNA2Q15822 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CHRNA2Q15822 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CHRNA2Q15822 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CHRNA2Q15822 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CHRNA2Q15822 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CHRNA2Q15822 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
CHRNA2Q15822 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CHRNA2Q15822 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CHRNA2Q15822 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CHRNA2Q15822 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CHRNA2Q15822 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CHRNA2Q15822 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CHRNA2Q15822 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CHRNA2Q15822 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CHRNA2Q15822 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CHRNA2Q15822 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CHRNA2Q15822 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CHRNA2Q15822 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CHRNA2Q15822 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CHRNA2Q15822 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CHRNA2Q15822 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CHRNA2Q15822 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CHRNA2Q15822 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
CHRNA2Q15822 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CHRNA2Q15822 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
CHRNA2Q15822 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CHRNA2Q15822 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CHRNA2Q15822 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CHRNA2Q15822 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CHRNA2Q15822 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CHRNA2Q15822 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CHRNA2Q15822 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CHRNA2Q15822 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CHRNA2Q15822 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CHRNA2Q15822 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CHRNA2Q15822 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CHRNA2Q15822 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CHRNA2Q15822 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CHRNA2Q15822 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CHRNA2Q15822 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CHRNA2Q15822 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CHRNA2Q15822 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CHRNA2Q15822 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CHRNA2Q15822 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CHRNA2Q15822 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
CHRNA2Q15822 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CHRNA2Q15822 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CHRNA2Q15822 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CHRNA2Q15822 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CHRNA2Q15822 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CHRNA2Q15822 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CHRNA2Q15822 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CHRNA2Q15822 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CHRNA2Q15822 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CHRNA2Q15822 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CHRNA2Q15822 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CHRNA2Q15822 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CHRNA2Q15822 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CHRNA2Q15822 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CHRNA2Q15822 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CHRNA2Q15822 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CHRNA2Q15822 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CHRNA2Q15822 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CHRNA2Q15822 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CHRNA2Q15822 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CHRNA2Q15822 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CHRNA2Q15822 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CHRNA2Q15822 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CHRNA2Q15822 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CHRNA2Q15822 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CHRNA2Q15822 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CHRNA2Q15822 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CHRNA2Q15822 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CHRNA2Q15822 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CHRNA2Q15822 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CHRNA2Q15822 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CHRNA2Q15822 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CHRNA2Q15822 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CHRNA2Q15822 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CHRNA2Q15822 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms