Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NKX1-1Q15270 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NKX1-1Q15270 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
NKX1-1Q15270 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NKX1-1Q15270 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
NKX1-1Q15270 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NKX1-1Q15270 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NKX1-1Q15270 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
NKX1-1Q15270 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
NKX1-1Q15270 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NKX1-1Q15270 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NKX1-1Q15270 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NKX1-1Q15270 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NKX1-1Q15270 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
NKX1-1Q15270 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NKX1-1Q15270 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NKX1-1Q15270 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NKX1-1Q15270 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NKX1-1Q15270 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NKX1-1Q15270 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NKX1-1Q15270 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NKX1-1Q15270 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NKX1-1Q15270 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NKX1-1Q15270 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NKX1-1Q15270 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NKX1-1Q15270 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NKX1-1Q15270 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NKX1-1Q15270 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NKX1-1Q15270 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NKX1-1Q15270 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NKX1-1Q15270 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NKX1-1Q15270 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NKX1-1Q15270 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NKX1-1Q15270 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NKX1-1Q15270 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NKX1-1Q15270 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NKX1-1Q15270 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NKX1-1Q15270 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NKX1-1Q15270 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NKX1-1Q15270 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NKX1-1Q15270 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NKX1-1Q15270 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NKX1-1Q15270 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NKX1-1Q15270 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NKX1-1Q15270 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NKX1-1Q15270 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NKX1-1Q15270 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NKX1-1Q15270 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NKX1-1Q15270 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NKX1-1Q15270 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
NKX1-1Q15270 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NKX1-1Q15270 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NKX1-1Q15270 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
NKX1-1Q15270 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NKX1-1Q15270 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NKX1-1Q15270 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NKX1-1Q15270 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NKX1-1Q15270 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NKX1-1Q15270 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NKX1-1Q15270 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NKX1-1Q15270 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NKX1-1Q15270 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NKX1-1Q15270 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NKX1-1Q15270 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NKX1-1Q15270 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NKX1-1Q15270 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NKX1-1Q15270 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NKX1-1Q15270 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NKX1-1Q15270 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NKX1-1Q15270 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NKX1-1Q15270 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NKX1-1Q15270 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NKX1-1Q15270 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NKX1-1Q15270 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NKX1-1Q15270 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NKX1-1Q15270 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NKX1-1Q15270 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NKX1-1Q15270 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NKX1-1Q15270 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
NKX1-1Q15270 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
NKX1-1Q15270 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NKX1-1Q15270 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NKX1-1Q15270 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NKX1-1Q15270 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NKX1-1Q15270 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NKX1-1Q15270 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NKX1-1Q15270 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NKX1-1Q15270 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NKX1-1Q15270 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NKX1-1Q15270 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NKX1-1Q15270 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NKX1-1Q15270 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NKX1-1Q15270 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NKX1-1Q15270 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NKX1-1Q15270 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NKX1-1Q15270 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NKX1-1Q15270 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NKX1-1Q15270 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NKX1-1Q15270 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NKX1-1Q15270 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms