Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCF4Q15080 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCF4Q15080 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCF4Q15080 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCF4Q15080 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCF4Q15080 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCF4Q15080 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCF4Q15080 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCF4Q15080 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCF4Q15080 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCF4Q15080 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCF4Q15080 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCF4Q15080 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
NCF4Q15080 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCF4Q15080 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCF4Q15080 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCF4Q15080 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCF4Q15080 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCF4Q15080 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCF4Q15080 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCF4Q15080 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCF4Q15080 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCF4Q15080 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCF4Q15080 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCF4Q15080 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCF4Q15080 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCF4Q15080 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCF4Q15080 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NCF4Q15080 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCF4Q15080 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCF4Q15080 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCF4Q15080 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NCF4Q15080 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NCF4Q15080 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NCF4Q15080 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NCF4Q15080 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCF4Q15080 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCF4Q15080 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCF4Q15080 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCF4Q15080 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCF4Q15080 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCF4Q15080 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCF4Q15080 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCF4Q15080 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCF4Q15080 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCF4Q15080 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCF4Q15080 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCF4Q15080 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCF4Q15080 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCF4Q15080 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCF4Q15080 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCF4Q15080 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCF4Q15080 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCF4Q15080 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCF4Q15080 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCF4Q15080 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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NCF4Q15080 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCF4Q15080 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCF4Q15080 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCF4Q15080 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCF4Q15080 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NCF4Q15080 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCF4Q15080 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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NCF4Q15080 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCF4Q15080 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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NCF4Q15080 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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NCF4Q15080 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCF4Q15080 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NCF4Q15080 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCF4Q15080 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCF4Q15080 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCF4Q15080 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NCF4Q15080 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCF4Q15080 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCF4Q15080 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCF4Q15080 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCF4Q15080 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCF4Q15080 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCF4Q15080 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NCF4Q15080 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NCF4Q15080 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NCF4Q15080 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
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