Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNIP1Q15025 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNIP1Q15025 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNIP1Q15025 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNIP1Q15025 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNIP1Q15025 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNIP1Q15025 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNIP1Q15025 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNIP1Q15025 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNIP1Q15025 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNIP1Q15025 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNIP1Q15025 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNIP1Q15025 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNIP1Q15025 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNIP1Q15025 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNIP1Q15025 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNIP1Q15025 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNIP1Q15025 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNIP1Q15025 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNIP1Q15025 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNIP1Q15025 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNIP1Q15025 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TNIP1Q15025 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNIP1Q15025 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNIP1Q15025 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TNIP1Q15025 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNIP1Q15025 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNIP1Q15025 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNIP1Q15025 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNIP1Q15025 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TNIP1Q15025 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNIP1Q15025 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNIP1Q15025 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNIP1Q15025 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNIP1Q15025 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNIP1Q15025 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNIP1Q15025 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNIP1Q15025 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TNIP1Q15025 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNIP1Q15025 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNIP1Q15025 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNIP1Q15025 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TNIP1Q15025 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNIP1Q15025 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNIP1Q15025 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TNIP1Q15025 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TNIP1Q15025 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TNIP1Q15025 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNIP1Q15025 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNIP1Q15025 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNIP1Q15025 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNIP1Q15025 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TNIP1Q15025 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TNIP1Q15025 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNIP1Q15025 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNIP1Q15025 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TNIP1Q15025 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNIP1Q15025 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNIP1Q15025 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNIP1Q15025 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNIP1Q15025 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNIP1Q15025 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNIP1Q15025 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNIP1Q15025 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNIP1Q15025 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNIP1Q15025 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNIP1Q15025 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNIP1Q15025 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNIP1Q15025 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNIP1Q15025 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TNIP1Q15025 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNIP1Q15025 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNIP1Q15025 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TNIP1Q15025 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNIP1Q15025 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNIP1Q15025 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNIP1Q15025 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNIP1Q15025 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TNIP1Q15025 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNIP1Q15025 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNIP1Q15025 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNIP1Q15025 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNIP1Q15025 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNIP1Q15025 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNIP1Q15025 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNIP1Q15025 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNIP1Q15025 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNIP1Q15025 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNIP1Q15025 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNIP1Q15025 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNIP1Q15025 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TNIP1Q15025 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNIP1Q15025 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNIP1Q15025 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNIP1Q15025 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNIP1Q15025 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNIP1Q15025 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TNIP1Q15025 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TNIP1Q15025 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
TNIP1Q15025 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms