Protein–RNA interactions for Protein: Q14978

NOLC1, Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOLC1Q14978 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.051e-8■■■□□ 15.5
NOLC1Q14978 SHMT2-205ENST00000553474 1765 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 01e-8■■■□□ 15.5
NOLC1Q14978 SHMT2-207ENST00000553837 2152 ntTSL 514.67□□□□□ -0.061e-8■■■□□ 15.5
NOLC1Q14978 SHMT2-201ENST00000328923 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.091e-8■■■□□ 15.5
NOLC1Q14978 SHMT2-233ENST00000557529 1369 ntTSL 213.73□□□□□ -0.211e-8■■■□□ 15.5
NOLC1Q14978 SHMT2-212ENST00000554467 3416 ntTSL 213.53□□□□□ -0.241e-8■■■□□ 15.5
NOLC1Q14978 GLG1-212ENST00000567911 599 ntTSL 311.4□□□□□ -0.582e-6■■■□□ 15.5
NOLC1Q14978 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.871e-323■■■□□ 15.5
NOLC1Q14978 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.41e-323■■■□□ 15.5
NOLC1Q14978 EIF5-203ENST00000558265 872 ntTSL 515.12■□□□□ 0.011e-323■■■□□ 15.5
NOLC1Q14978 EIF5-205ENST00000558506 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.11e-323■■■□□ 15.5
NOLC1Q14978 EIF5-221ENST00000561439 719 ntTSL 28.67□□□□□ -1.021e-323■■■□□ 15.5
NOLC1Q14978 EIF5-217ENST00000561023 565 ntTSL 25.61□□□□□ -1.511e-323■■■□□ 15.5
NOLC1Q14978 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC2.29□□□□□ -2.041e-323■■■□□ 15.5
NOLC1Q14978 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.122e-11■■■□□ 15.5
NOLC1Q14978 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.022e-11■■■□□ 15.5
NOLC1Q14978 SNRPC-203ENST00000374018 600 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.552e-11■■■□□ 15.5
NOLC1Q14978 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.74e-11■■■□□ 15.4
NOLC1Q14978 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.554e-11■■■□□ 15.4
NOLC1Q14978 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.221e-7■■■□□ 15.4
NOLC1Q14978 SRSF9-206ENST00000603963 1043 ntTSL 523.81■■□□□ 1.41e-7■■■□□ 15.4
NOLC1Q14978 SRSF9-203ENST00000548326 1704 nt10.13□□□□□ -0.791e-7■■■□□ 15.4
NOLC1Q14978 SRSF9-204ENST00000548792 1446 ntTSL 29.99□□□□□ -0.811e-7■■■□□ 15.4
NOLC1Q14978 LIG1-206ENST00000594067 2697 ntTSL 219.68■□□□□ 0.748e-7■■■□□ 15.4
NOLC1Q14978 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.38e-7■■■□□ 15.4
NOLC1Q14978 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.298e-7■■■□□ 15.4
NOLC1Q14978 LIG1-214ENST00000597146 589 ntTSL 216.76■□□□□ 0.278e-7■■■□□ 15.4
NOLC1Q14978 LIG1-218ENST00000599322 620 ntTSL 215.47■□□□□ 0.078e-7■■■□□ 15.4
NOLC1Q14978 LIG1-201ENST00000263274 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 08e-7■■■□□ 15.4
NOLC1Q14978 LIG1-207ENST00000594759 4102 ntTSL 1 (best)14.93□□□□□ -0.028e-7■■■□□ 15.4
NOLC1Q14978 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.287e-7■■■□□ 15.4
NOLC1Q14978 PLEC-208ENST00000436759 14787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.215e-6■■■□□ 15.4
NOLC1Q14978 PLEC-202ENST00000345136 14803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.235e-6■■■□□ 15.4
NOLC1Q14978 PLEC-201ENST00000322810 15249 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.265e-6■■■□□ 15.4
NOLC1Q14978 PLEC-210ENST00000527096 13713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.355e-6■■■□□ 15.4
NOLC1Q14978 PLEC-204ENST00000354958 14751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.395e-6■■■□□ 15.4
NOLC1Q14978 PLEC-206ENST00000357649 14689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.425e-6■■■□□ 15.4
NOLC1Q14978 PLEC-205ENST00000356346 14683 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.435e-6■■■□□ 15.4
NOLC1Q14978 PLEC-203ENST00000354589 14736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.435e-6■■■□□ 15.4
NOLC1Q14978 PLEC-207ENST00000398774 14646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.555e-6■■■□□ 15.4
NOLC1Q14978 CANX-218ENST00000514032 1876 ntTSL 223.11■■□□□ 1.291e-9■■■□□ 15.4
NOLC1Q14978 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.491e-9■■■□□ 15.4
NOLC1Q14978 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.121e-9■■■□□ 15.4
NOLC1Q14978 CANX-209ENST00000504734 2232 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.011e-9■■■□□ 15.4
NOLC1Q14978 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.92e-6■■■□□ 15.4
NOLC1Q14978 FLNB-203ENST00000419752 2002 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.193e-7■■■□□ 15.4
NOLC1Q14978 FLNB-211ENST00000484981 932 ntTSL 511.13□□□□□ -0.633e-7■■■□□ 15.4
NOLC1Q14978 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.43□□□□□ -2.181e-323■■■□□ 15.4
NOLC1Q14978 EEF1B2-211ENST00000482103 587 ntTSL 26.89□□□□□ -1.311e-323■■■□□ 15.4
NOLC1Q14978 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC4.03□□□□□ -1.761e-323■■■□□ 15.4
NOLC1Q14978 C2-217ENST00000497706 1609 ntTSL 516.52■□□□□ 0.242e-13■■■□□ 15.4
NOLC1Q14978 C2-214ENST00000485690 894 ntTSL 510.06□□□□□ -0.82e-13■■■□□ 15.4
NOLC1Q14978 C14orf159-221ENST00000521334 909 ntTSL 321■□□□□ 0.952e-36■■■□□ 15.4
NOLC1Q14978 C14orf159-219ENST00000521077 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.052e-36■■■□□ 15.4
NOLC1Q14978 C14orf159-225ENST00000522837 558 ntTSL 413.88□□□□□ -0.192e-36■■■□□ 15.4
NOLC1Q14978 C14orf159-218ENST00000521064 544 ntTSL 413.64□□□□□ -0.232e-36■■■□□ 15.4
NOLC1Q14978 C14orf159-223ENST00000522322 2856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.282e-36■■■□□ 15.4
NOLC1Q14978 C14orf159-201ENST00000256324 2967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.32e-36■■■□□ 15.4
NOLC1Q14978 C14orf159-230ENST00000523837 2814 ntTSL 513.14□□□□□ -0.312e-36■■■□□ 15.4
NOLC1Q14978 C14orf159-232ENST00000523894 862 ntTSL 1 (best)13.09□□□□□ -0.312e-36■■■□□ 15.4
NOLC1Q14978 C14orf159-214ENST00000519950 1060 ntTSL 313.09□□□□□ -0.312e-36■■■□□ 15.4
NOLC1Q14978 C14orf159-204ENST00000428926 2538 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.322e-36■■■□□ 15.4
NOLC1Q14978 C14orf159-229ENST00000523816 2764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.332e-36■■■□□ 15.4
NOLC1Q14978 C14orf159-222ENST00000522170 853 ntTSL 312.91□□□□□ -0.342e-36■■■□□ 15.4
NOLC1Q14978 C14orf159-228ENST00000523771 2976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.392e-36■■■□□ 15.4
NOLC1Q14978 C14orf159-217ENST00000520328 2687 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.42e-36■■■□□ 15.4
NOLC1Q14978 C14orf159-215ENST00000519994 1148 ntTSL 1 (best)12.46□□□□□ -0.412e-36■■■□□ 15.4
NOLC1Q14978 C14orf159-206ENST00000517362 583 ntTSL 412.28□□□□□ -0.442e-36■■■□□ 15.4
NOLC1Q14978 C14orf159-211ENST00000518868 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.472e-36■■■□□ 15.4
NOLC1Q14978 C14orf159-207ENST00000517518 1597 ntTSL 1 (best)11.42□□□□□ -0.582e-36■■■□□ 15.4
NOLC1Q14978 C14orf159-212ENST00000518871 484 ntTSL 411.32□□□□□ -0.62e-36■■■□□ 15.4
NOLC1Q14978 C14orf159-210ENST00000518665 959 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -12e-36■■■□□ 15.4
NOLC1Q14978 C14orf159-233ENST00000524232 550 ntTSL 28.52□□□□□ -1.052e-36■■■□□ 15.4
NOLC1Q14978 C14orf159-213ENST00000519019 834 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.132e-36■■■□□ 15.4
NOLC1Q14978 C14orf159-231ENST00000523879 650 ntTSL 57.91□□□□□ -1.142e-36■■■□□ 15.4
NOLC1Q14978 C14orf159-220ENST00000521081 622 ntTSL 26.98□□□□□ -1.292e-36■■■□□ 15.4
NOLC1Q14978 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC6.55□□□□□ -1.362e-36■■■□□ 15.4
NOLC1Q14978 C14orf159-209ENST00000518649 555 ntTSL 46.44□□□□□ -1.382e-36■■■□□ 15.4
NOLC1Q14978 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.292e-7■■■□□ 15.4
NOLC1Q14978 CBFA2T3-210ENST00000569464 1327 ntTSL 1 (best)15.14■□□□□ 0.012e-7■■■□□ 15.4
NOLC1Q14978 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC2.8□□□□□ -1.965e-27■■■□□ 15.4
NOLC1Q14978 TFRC-210ENST00000465288 560 ntTSL 59.48□□□□□ -0.893e-7■■■□□ 15.4
NOLC1Q14978 TFRC-212ENST00000477148 570 ntTSL 47.94□□□□□ -1.143e-7■■■□□ 15.4
NOLC1Q14978 FUBP1-212ENST00000492405 668 ntTSL 315.21■□□□□ 0.031e-6■■■□□ 15.3
NOLC1Q14978 FUBP1-213ENST00000492724 583 ntTSL 315.21■□□□□ 0.031e-6■■■□□ 15.3
NOLC1Q14978 FUBP1-210ENST00000488814 612 ntTSL 37.19□□□□□ -1.261e-6■■■□□ 15.3
NOLC1Q14978 RPS16-203ENST00000595386 1035 ntTSL 217.28■□□□□ 0.361e-13■■■□□ 15.3
NOLC1Q14978 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.091e-13■■■□□ 15.3
NOLC1Q14978 RPS16-201ENST00000251453 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.341e-13■■■□□ 15.3
NOLC1Q14978 RPS16-206ENST00000601390 2389 ntTSL 212.59□□□□□ -0.391e-13■■■□□ 15.3
NOLC1Q14978 RPS16-208ENST00000602153 444 ntTSL 211.35□□□□□ -0.591e-13■■■□□ 15.3
NOLC1Q14978 RPS16-207ENST00000601655 492 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.661e-13■■■□□ 15.3
NOLC1Q14978 RPS16-204ENST00000599539 555 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.711e-13■■■□□ 15.3
NOLC1Q14978 RPS16-205ENST00000599705 407 ntTSL 310.24□□□□□ -0.771e-13■■■□□ 15.3
NOLC1Q14978 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.093e-8■■■□□ 15.3
NOLC1Q14978 ACTR3-205ENST00000478928 5965 ntTSL 23.73□□□□□ -1.813e-8■■■□□ 15.3
NOLC1Q14978 RNASET2-209ENST00000499370 2164 ntTSL 213.21□□□□□ -0.37e-9■■■□□ 15.3
NOLC1Q14978 PTPRF-208ENST00000437607 788 ntTSL 1 (best)13.11□□□□□ -0.317e-9■■■□□ 15.3
NOLC1Q14978 IPO7-201ENST00000379719 6191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.093e-6■■■□□ 15.3
NOLC1Q14978 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC4.3□□□□□ -1.721e-323■■■□□ 15.3
Retrieved 100 of 7,921 protein–RNA pairs in 73.8 ms