Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MDC1Q14676 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MDC1Q14676 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MDC1Q14676 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MDC1Q14676 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MDC1Q14676 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MDC1Q14676 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
MDC1Q14676 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MDC1Q14676 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MDC1Q14676 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MDC1Q14676 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MDC1Q14676 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MDC1Q14676 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MDC1Q14676 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MDC1Q14676 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MDC1Q14676 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MDC1Q14676 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MDC1Q14676 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MDC1Q14676 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MDC1Q14676 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MDC1Q14676 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MDC1Q14676 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MDC1Q14676 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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