Protein–RNA interactions for Protein: Q14653

IRF3, Interferon regulatory factor 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF3Q14653 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IRF3Q14653 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IRF3Q14653 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
IRF3Q14653 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
IRF3Q14653 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IRF3Q14653 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IRF3Q14653 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
IRF3Q14653 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IRF3Q14653 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
IRF3Q14653 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IRF3Q14653 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
IRF3Q14653 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IRF3Q14653 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
IRF3Q14653 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IRF3Q14653 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IRF3Q14653 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IRF3Q14653 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IRF3Q14653 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IRF3Q14653 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IRF3Q14653 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IRF3Q14653 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IRF3Q14653 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IRF3Q14653 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
IRF3Q14653 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IRF3Q14653 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IRF3Q14653 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IRF3Q14653 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
IRF3Q14653 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
IRF3Q14653 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IRF3Q14653 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IRF3Q14653 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
IRF3Q14653 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
IRF3Q14653 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
IRF3Q14653 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IRF3Q14653 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IRF3Q14653 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IRF3Q14653 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IRF3Q14653 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IRF3Q14653 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
IRF3Q14653 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
IRF3Q14653 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
IRF3Q14653 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
IRF3Q14653 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
IRF3Q14653 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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