Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL4A6Q14031 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL4A6Q14031 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL4A6Q14031 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL4A6Q14031 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL4A6Q14031 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL4A6Q14031 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL4A6Q14031 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL4A6Q14031 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL4A6Q14031 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL4A6Q14031 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL4A6Q14031 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL4A6Q14031 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL4A6Q14031 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL4A6Q14031 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL4A6Q14031 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL4A6Q14031 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
COL4A6Q14031 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL4A6Q14031 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL4A6Q14031 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL4A6Q14031 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
COL4A6Q14031 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL4A6Q14031 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL4A6Q14031 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL4A6Q14031 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL4A6Q14031 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL4A6Q14031 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL4A6Q14031 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL4A6Q14031 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL4A6Q14031 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL4A6Q14031 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL4A6Q14031 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
COL4A6Q14031 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL4A6Q14031 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL4A6Q14031 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL4A6Q14031 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
COL4A6Q14031 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
COL4A6Q14031 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL4A6Q14031 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL4A6Q14031 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL4A6Q14031 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL4A6Q14031 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL4A6Q14031 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL4A6Q14031 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL4A6Q14031 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL4A6Q14031 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL4A6Q14031 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL4A6Q14031 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL4A6Q14031 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL4A6Q14031 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL4A6Q14031 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL4A6Q14031 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL4A6Q14031 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL4A6Q14031 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL4A6Q14031 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL4A6Q14031 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL4A6Q14031 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL4A6Q14031 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL4A6Q14031 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL4A6Q14031 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
COL4A6Q14031 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL4A6Q14031 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL4A6Q14031 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL4A6Q14031 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL4A6Q14031 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
COL4A6Q14031 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
COL4A6Q14031 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
COL4A6Q14031 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
COL4A6Q14031 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL4A6Q14031 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL4A6Q14031 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL4A6Q14031 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL4A6Q14031 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL4A6Q14031 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL4A6Q14031 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL4A6Q14031 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL4A6Q14031 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL4A6Q14031 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL4A6Q14031 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL4A6Q14031 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL4A6Q14031 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL4A6Q14031 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL4A6Q14031 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL4A6Q14031 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL4A6Q14031 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL4A6Q14031 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL4A6Q14031 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL4A6Q14031 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL4A6Q14031 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
COL4A6Q14031 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL4A6Q14031 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL4A6Q14031 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL4A6Q14031 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
COL4A6Q14031 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL4A6Q14031 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL4A6Q14031 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL4A6Q14031 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL4A6Q14031 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL4A6Q14031 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL4A6Q14031 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
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