Protein–RNA interactions for Protein: Q13901

C1D, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1DQ13901 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C1DQ13901 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C1DQ13901 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C1DQ13901 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C1DQ13901 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
C1DQ13901 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C1DQ13901 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C1DQ13901 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C1DQ13901 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C1DQ13901 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C1DQ13901 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C1DQ13901 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C1DQ13901 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C1DQ13901 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C1DQ13901 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C1DQ13901 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C1DQ13901 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C1DQ13901 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C1DQ13901 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
C1DQ13901 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C1DQ13901 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C1DQ13901 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C1DQ13901 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C1DQ13901 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C1DQ13901 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C1DQ13901 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C1DQ13901 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C1DQ13901 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C1DQ13901 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C1DQ13901 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C1DQ13901 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C1DQ13901 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C1DQ13901 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C1DQ13901 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C1DQ13901 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C1DQ13901 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C1DQ13901 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C1DQ13901 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C1DQ13901 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C1DQ13901 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C1DQ13901 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C1DQ13901 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C1DQ13901 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C1DQ13901 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C1DQ13901 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C1DQ13901 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C1DQ13901 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C1DQ13901 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C1DQ13901 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
C1DQ13901 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C1DQ13901 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C1DQ13901 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C1DQ13901 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
C1DQ13901 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C1DQ13901 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C1DQ13901 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C1DQ13901 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C1DQ13901 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C1DQ13901 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C1DQ13901 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C1DQ13901 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C1DQ13901 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C1DQ13901 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C1DQ13901 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C1DQ13901 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C1DQ13901 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C1DQ13901 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C1DQ13901 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C1DQ13901 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C1DQ13901 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C1DQ13901 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C1DQ13901 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
C1DQ13901 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
C1DQ13901 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
C1DQ13901 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
C1DQ13901 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
C1DQ13901 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
C1DQ13901 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
C1DQ13901 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
C1DQ13901 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
C1DQ13901 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C1DQ13901 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C1DQ13901 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C1DQ13901 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C1DQ13901 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C1DQ13901 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C1DQ13901 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C1DQ13901 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C1DQ13901 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C1DQ13901 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
C1DQ13901 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C1DQ13901 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C1DQ13901 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C1DQ13901 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C1DQ13901 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C1DQ13901 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C1DQ13901 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C1DQ13901 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C1DQ13901 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C1DQ13901 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
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