Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PKP1Q13835 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PKP1Q13835 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PKP1Q13835 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PKP1Q13835 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PKP1Q13835 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PKP1Q13835 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PKP1Q13835 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PKP1Q13835 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PKP1Q13835 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PKP1Q13835 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PKP1Q13835 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PKP1Q13835 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PKP1Q13835 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PKP1Q13835 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PKP1Q13835 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PKP1Q13835 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PKP1Q13835 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PKP1Q13835 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PKP1Q13835 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PKP1Q13835 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PKP1Q13835 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PKP1Q13835 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PKP1Q13835 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PKP1Q13835 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PKP1Q13835 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PKP1Q13835 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKP1Q13835 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKP1Q13835 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKP1Q13835 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKP1Q13835 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PKP1Q13835 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKP1Q13835 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKP1Q13835 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKP1Q13835 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKP1Q13835 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKP1Q13835 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKP1Q13835 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKP1Q13835 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKP1Q13835 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKP1Q13835 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKP1Q13835 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKP1Q13835 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKP1Q13835 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKP1Q13835 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKP1Q13835 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKP1Q13835 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKP1Q13835 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKP1Q13835 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKP1Q13835 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PKP1Q13835 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PKP1Q13835 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PKP1Q13835 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PKP1Q13835 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PKP1Q13835 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PKP1Q13835 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PKP1Q13835 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PKP1Q13835 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PKP1Q13835 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PKP1Q13835 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PKP1Q13835 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
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