Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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