Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CUL3Q13618 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CUL3Q13618 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CUL3Q13618 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CUL3Q13618 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CUL3Q13618 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CUL3Q13618 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CUL3Q13618 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL3Q13618 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL3Q13618 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL3Q13618 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL3Q13618 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL3Q13618 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL3Q13618 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL3Q13618 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL3Q13618 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL3Q13618 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL3Q13618 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL3Q13618 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CUL3Q13618 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CUL3Q13618 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CUL3Q13618 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CUL3Q13618 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CUL3Q13618 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CUL3Q13618 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CUL3Q13618 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CUL3Q13618 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CUL3Q13618 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CUL3Q13618 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CUL3Q13618 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CUL3Q13618 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CUL3Q13618 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL3Q13618 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL3Q13618 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL3Q13618 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL3Q13618 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL3Q13618 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL3Q13618 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL3Q13618 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL3Q13618 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL3Q13618 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL3Q13618 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL3Q13618 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL3Q13618 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL3Q13618 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL3Q13618 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL3Q13618 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CUL3Q13618 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CUL3Q13618 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CUL3Q13618 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CUL3Q13618 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CUL3Q13618 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CUL3Q13618 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CUL3Q13618 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CUL3Q13618 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CUL3Q13618 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CUL3Q13618 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CUL3Q13618 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CUL3Q13618 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CUL3Q13618 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CUL3Q13618 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CUL3Q13618 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CUL3Q13618 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL3Q13618 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL3Q13618 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL3Q13618 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL3Q13618 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL3Q13618 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL3Q13618 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL3Q13618 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL3Q13618 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL3Q13618 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL3Q13618 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL3Q13618 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
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