Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CUL1Q13616 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CUL1Q13616 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CUL1Q13616 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CUL1Q13616 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CUL1Q13616 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CUL1Q13616 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CUL1Q13616 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CUL1Q13616 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CUL1Q13616 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CUL1Q13616 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CUL1Q13616 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CUL1Q13616 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CUL1Q13616 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CUL1Q13616 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CUL1Q13616 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CUL1Q13616 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CUL1Q13616 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CUL1Q13616 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CUL1Q13616 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CUL1Q13616 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CUL1Q13616 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CUL1Q13616 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CUL1Q13616 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CUL1Q13616 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CUL1Q13616 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CUL1Q13616 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CUL1Q13616 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CUL1Q13616 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CUL1Q13616 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CUL1Q13616 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CUL1Q13616 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CUL1Q13616 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CUL1Q13616 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CUL1Q13616 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CUL1Q13616 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CUL1Q13616 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CUL1Q13616 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CUL1Q13616 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CUL1Q13616 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CUL1Q13616 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CUL1Q13616 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CUL1Q13616 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CUL1Q13616 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CUL1Q13616 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CUL1Q13616 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CUL1Q13616 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CUL1Q13616 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CUL1Q13616 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CUL1Q13616 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CUL1Q13616 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CUL1Q13616 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CUL1Q13616 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CUL1Q13616 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CUL1Q13616 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CUL1Q13616 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CUL1Q13616 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CUL1Q13616 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CUL1Q13616 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CUL1Q13616 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CUL1Q13616 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CUL1Q13616 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CUL1Q13616 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CUL1Q13616 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CUL1Q13616 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CUL1Q13616 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CUL1Q13616 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CUL1Q13616 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CUL1Q13616 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CUL1Q13616 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CUL1Q13616 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CUL1Q13616 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CUL1Q13616 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CUL1Q13616 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CUL1Q13616 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CUL1Q13616 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CUL1Q13616 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CUL1Q13616 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CUL1Q13616 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CUL1Q13616 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CUL1Q13616 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CUL1Q13616 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CUL1Q13616 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CUL1Q13616 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CUL1Q13616 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CUL1Q13616 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CUL1Q13616 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CUL1Q13616 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CUL1Q13616 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CUL1Q13616 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CUL1Q13616 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CUL1Q13616 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CUL1Q13616 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CUL1Q13616 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CUL1Q13616 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CUL1Q13616 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CUL1Q13616 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CUL1Q13616 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CUL1Q13616 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CUL1Q13616 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
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