Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NAE1Q13564 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NAE1Q13564 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NAE1Q13564 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NAE1Q13564 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NAE1Q13564 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NAE1Q13564 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NAE1Q13564 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NAE1Q13564 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NAE1Q13564 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NAE1Q13564 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NAE1Q13564 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NAE1Q13564 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NAE1Q13564 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NAE1Q13564 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NAE1Q13564 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NAE1Q13564 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NAE1Q13564 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NAE1Q13564 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NAE1Q13564 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NAE1Q13564 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NAE1Q13564 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NAE1Q13564 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NAE1Q13564 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NAE1Q13564 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NAE1Q13564 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NAE1Q13564 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NAE1Q13564 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NAE1Q13564 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NAE1Q13564 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NAE1Q13564 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NAE1Q13564 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NAE1Q13564 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NAE1Q13564 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NAE1Q13564 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NAE1Q13564 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NAE1Q13564 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NAE1Q13564 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NAE1Q13564 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NAE1Q13564 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NAE1Q13564 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NAE1Q13564 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NAE1Q13564 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NAE1Q13564 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NAE1Q13564 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NAE1Q13564 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NAE1Q13564 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NAE1Q13564 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NAE1Q13564 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NAE1Q13564 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NAE1Q13564 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NAE1Q13564 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NAE1Q13564 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NAE1Q13564 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NAE1Q13564 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NAE1Q13564 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NAE1Q13564 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NAE1Q13564 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NAE1Q13564 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NAE1Q13564 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NAE1Q13564 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NAE1Q13564 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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