Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
NEUROD1Q13562 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
NEUROD1Q13562 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
NEUROD1Q13562 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
NEUROD1Q13562 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
NEUROD1Q13562 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
NEUROD1Q13562 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
NEUROD1Q13562 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
NEUROD1Q13562 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
NEUROD1Q13562 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
NEUROD1Q13562 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
NEUROD1Q13562 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
NEUROD1Q13562 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
NEUROD1Q13562 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
NEUROD1Q13562 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
NEUROD1Q13562 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
NEUROD1Q13562 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
NEUROD1Q13562 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
NEUROD1Q13562 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
NEUROD1Q13562 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
NEUROD1Q13562 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
NEUROD1Q13562 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
NEUROD1Q13562 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
NEUROD1Q13562 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
NEUROD1Q13562 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
NEUROD1Q13562 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
NEUROD1Q13562 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
NEUROD1Q13562 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
NEUROD1Q13562 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
NEUROD1Q13562 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
NEUROD1Q13562 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
NEUROD1Q13562 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
NEUROD1Q13562 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
NEUROD1Q13562 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.81
NEUROD1Q13562 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
NEUROD1Q13562 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
NEUROD1Q13562 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
NEUROD1Q13562 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
NEUROD1Q13562 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
NEUROD1Q13562 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
NEUROD1Q13562 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
NEUROD1Q13562 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
NEUROD1Q13562 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NEUROD1Q13562 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NEUROD1Q13562 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
NEUROD1Q13562 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
NEUROD1Q13562 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
NEUROD1Q13562 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
NEUROD1Q13562 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC32.55■■■□□ 2.8
NEUROD1Q13562 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
NEUROD1Q13562 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
NEUROD1Q13562 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
NEUROD1Q13562 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
NEUROD1Q13562 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
NEUROD1Q13562 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
NEUROD1Q13562 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
NEUROD1Q13562 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
NEUROD1Q13562 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
NEUROD1Q13562 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
NEUROD1Q13562 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
NEUROD1Q13562 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
NEUROD1Q13562 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
NEUROD1Q13562 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
NEUROD1Q13562 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
NEUROD1Q13562 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
NEUROD1Q13562 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
NEUROD1Q13562 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
NEUROD1Q13562 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
NEUROD1Q13562 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
NEUROD1Q13562 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
NEUROD1Q13562 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
NEUROD1Q13562 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
NEUROD1Q13562 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
NEUROD1Q13562 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
NEUROD1Q13562 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
NEUROD1Q13562 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
NEUROD1Q13562 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
NEUROD1Q13562 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NEUROD1Q13562 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
NEUROD1Q13562 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
NEUROD1Q13562 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NEUROD1Q13562 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
NEUROD1Q13562 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC32.5■■■□□ 2.79
NEUROD1Q13562 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
NEUROD1Q13562 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
NEUROD1Q13562 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
NEUROD1Q13562 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
NEUROD1Q13562 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
NEUROD1Q13562 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
NEUROD1Q13562 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
NEUROD1Q13562 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NEUROD1Q13562 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NEUROD1Q13562 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NEUROD1Q13562 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
NEUROD1Q13562 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC32.48■■■□□ 2.79
NEUROD1Q13562 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NEUROD1Q13562 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NEUROD1Q13562 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NEUROD1Q13562 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NEUROD1Q13562 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
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