Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB3Q13509 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB3Q13509 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB3Q13509 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB3Q13509 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB3Q13509 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB3Q13509 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB3Q13509 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB3Q13509 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB3Q13509 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB3Q13509 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB3Q13509 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB3Q13509 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB3Q13509 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB3Q13509 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB3Q13509 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB3Q13509 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB3Q13509 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB3Q13509 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB3Q13509 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB3Q13509 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB3Q13509 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB3Q13509 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB3Q13509 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB3Q13509 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB3Q13509 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB3Q13509 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB3Q13509 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB3Q13509 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB3Q13509 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB3Q13509 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB3Q13509 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB3Q13509 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB3Q13509 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB3Q13509 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB3Q13509 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB3Q13509 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB3Q13509 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB3Q13509 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB3Q13509 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB3Q13509 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB3Q13509 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB3Q13509 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB3Q13509 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB3Q13509 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB3Q13509 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB3Q13509 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB3Q13509 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB3Q13509 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB3Q13509 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB3Q13509 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB3Q13509 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB3Q13509 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB3Q13509 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB3Q13509 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB3Q13509 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB3Q13509 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB3Q13509 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB3Q13509 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB3Q13509 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB3Q13509 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB3Q13509 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB3Q13509 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB3Q13509 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB3Q13509 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB3Q13509 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB3Q13509 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB3Q13509 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB3Q13509 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB3Q13509 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB3Q13509 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TUBB3Q13509 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB3Q13509 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB3Q13509 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB3Q13509 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB3Q13509 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB3Q13509 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB3Q13509 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB3Q13509 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB3Q13509 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB3Q13509 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB3Q13509 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB3Q13509 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB3Q13509 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB3Q13509 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB3Q13509 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB3Q13509 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB3Q13509 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB3Q13509 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB3Q13509 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB3Q13509 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB3Q13509 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB3Q13509 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB3Q13509 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB3Q13509 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB3Q13509 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB3Q13509 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB3Q13509 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB3Q13509 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB3Q13509 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms