Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

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Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PICALMQ13492 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PICALMQ13492 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PICALMQ13492 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PICALMQ13492 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PICALMQ13492 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PICALMQ13492 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PICALMQ13492 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PICALMQ13492 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PICALMQ13492 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PICALMQ13492 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PICALMQ13492 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PICALMQ13492 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PICALMQ13492 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PICALMQ13492 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PICALMQ13492 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PICALMQ13492 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PICALMQ13492 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PICALMQ13492 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PICALMQ13492 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PICALMQ13492 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PICALMQ13492 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PICALMQ13492 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PICALMQ13492 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PICALMQ13492 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PICALMQ13492 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PICALMQ13492 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PICALMQ13492 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PICALMQ13492 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PICALMQ13492 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PICALMQ13492 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PICALMQ13492 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PICALMQ13492 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PICALMQ13492 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PICALMQ13492 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PICALMQ13492 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PICALMQ13492 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PICALMQ13492 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PICALMQ13492 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PICALMQ13492 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PICALMQ13492 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PICALMQ13492 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PICALMQ13492 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PICALMQ13492 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PICALMQ13492 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PICALMQ13492 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PICALMQ13492 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PICALMQ13492 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PICALMQ13492 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PICALMQ13492 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PICALMQ13492 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PICALMQ13492 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PICALMQ13492 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PICALMQ13492 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PICALMQ13492 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PICALMQ13492 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PICALMQ13492 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PICALMQ13492 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PICALMQ13492 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PICALMQ13492 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PICALMQ13492 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PICALMQ13492 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PICALMQ13492 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PICALMQ13492 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PICALMQ13492 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PICALMQ13492 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PICALMQ13492 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PICALMQ13492 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PICALMQ13492 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PICALMQ13492 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PICALMQ13492 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PICALMQ13492 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PICALMQ13492 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PICALMQ13492 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PICALMQ13492 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PICALMQ13492 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PICALMQ13492 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PICALMQ13492 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PICALMQ13492 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PICALMQ13492 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PICALMQ13492 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PICALMQ13492 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PICALMQ13492 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PICALMQ13492 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PICALMQ13492 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PICALMQ13492 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PICALMQ13492 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PICALMQ13492 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PICALMQ13492 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PICALMQ13492 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PICALMQ13492 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PICALMQ13492 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PICALMQ13492 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PICALMQ13492 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PICALMQ13492 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PICALMQ13492 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PICALMQ13492 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PICALMQ13492 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PICALMQ13492 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PICALMQ13492 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
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