Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SF3B2Q13435 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SF3B2Q13435 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SF3B2Q13435 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SF3B2Q13435 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SF3B2Q13435 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SF3B2Q13435 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SF3B2Q13435 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SF3B2Q13435 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SF3B2Q13435 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SF3B2Q13435 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SF3B2Q13435 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SF3B2Q13435 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SF3B2Q13435 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SF3B2Q13435 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SF3B2Q13435 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SF3B2Q13435 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SF3B2Q13435 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SF3B2Q13435 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SF3B2Q13435 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SF3B2Q13435 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SF3B2Q13435 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SF3B2Q13435 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SF3B2Q13435 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SF3B2Q13435 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SF3B2Q13435 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SF3B2Q13435 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SF3B2Q13435 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SF3B2Q13435 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SF3B2Q13435 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SF3B2Q13435 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SF3B2Q13435 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SF3B2Q13435 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SF3B2Q13435 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SF3B2Q13435 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SF3B2Q13435 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SF3B2Q13435 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SF3B2Q13435 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SF3B2Q13435 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SF3B2Q13435 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
SF3B2Q13435 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SF3B2Q13435 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SF3B2Q13435 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SF3B2Q13435 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SF3B2Q13435 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SF3B2Q13435 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SF3B2Q13435 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SF3B2Q13435 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SF3B2Q13435 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SF3B2Q13435 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SF3B2Q13435 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SF3B2Q13435 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SF3B2Q13435 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SF3B2Q13435 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SF3B2Q13435 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SF3B2Q13435 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SF3B2Q13435 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SF3B2Q13435 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SF3B2Q13435 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SF3B2Q13435 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SF3B2Q13435 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SF3B2Q13435 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SF3B2Q13435 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SF3B2Q13435 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SF3B2Q13435 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SF3B2Q13435 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SF3B2Q13435 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SF3B2Q13435 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SF3B2Q13435 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SF3B2Q13435 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SF3B2Q13435 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SF3B2Q13435 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SF3B2Q13435 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SF3B2Q13435 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SF3B2Q13435 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SF3B2Q13435 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SF3B2Q13435 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SF3B2Q13435 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SF3B2Q13435 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SF3B2Q13435 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SF3B2Q13435 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SF3B2Q13435 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SF3B2Q13435 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SF3B2Q13435 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SF3B2Q13435 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SF3B2Q13435 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SF3B2Q13435 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SF3B2Q13435 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SF3B2Q13435 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SF3B2Q13435 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SF3B2Q13435 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SF3B2Q13435 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SF3B2Q13435 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SF3B2Q13435 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SF3B2Q13435 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SF3B2Q13435 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SF3B2Q13435 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SF3B2Q13435 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SF3B2Q13435 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SF3B2Q13435 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
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