Protein–RNA interactions for Protein: Q13405

MRPL49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL49Q13405 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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