Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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SCGB2A2Q13296 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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SCGB2A2Q13296 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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SCGB2A2Q13296 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
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SCGB2A2Q13296 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCGB2A2Q13296 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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SCGB2A2Q13296 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCGB2A2Q13296 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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SCGB2A2Q13296 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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SCGB2A2Q13296 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCGB2A2Q13296 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SCGB2A2Q13296 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCGB2A2Q13296 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCGB2A2Q13296 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCGB2A2Q13296 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCGB2A2Q13296 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCGB2A2Q13296 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCGB2A2Q13296 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCGB2A2Q13296 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCGB2A2Q13296 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCGB2A2Q13296 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCGB2A2Q13296 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCGB2A2Q13296 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SCGB2A2Q13296 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCGB2A2Q13296 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SCGB2A2Q13296 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCGB2A2Q13296 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SCGB2A2Q13296 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCGB2A2Q13296 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
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