Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SRSF6Q13247 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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