Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NME3Q13232 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NME3Q13232 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NME3Q13232 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NME3Q13232 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NME3Q13232 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NME3Q13232 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NME3Q13232 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NME3Q13232 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NME3Q13232 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NME3Q13232 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NME3Q13232 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NME3Q13232 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NME3Q13232 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NME3Q13232 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NME3Q13232 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NME3Q13232 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NME3Q13232 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NME3Q13232 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NME3Q13232 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NME3Q13232 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NME3Q13232 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NME3Q13232 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NME3Q13232 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NME3Q13232 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NME3Q13232 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NME3Q13232 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NME3Q13232 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NME3Q13232 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NME3Q13232 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NME3Q13232 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NME3Q13232 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NME3Q13232 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NME3Q13232 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NME3Q13232 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NME3Q13232 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NME3Q13232 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NME3Q13232 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NME3Q13232 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NME3Q13232 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NME3Q13232 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NME3Q13232 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NME3Q13232 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NME3Q13232 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NME3Q13232 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NME3Q13232 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NME3Q13232 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NME3Q13232 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NME3Q13232 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NME3Q13232 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NME3Q13232 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NME3Q13232 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NME3Q13232 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NME3Q13232 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NME3Q13232 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NME3Q13232 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NME3Q13232 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NME3Q13232 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NME3Q13232 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NME3Q13232 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NME3Q13232 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NME3Q13232 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NME3Q13232 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NME3Q13232 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NME3Q13232 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NME3Q13232 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NME3Q13232 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NME3Q13232 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NME3Q13232 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NME3Q13232 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NME3Q13232 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NME3Q13232 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NME3Q13232 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
NME3Q13232 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NME3Q13232 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NME3Q13232 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NME3Q13232 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NME3Q13232 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NME3Q13232 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NME3Q13232 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NME3Q13232 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NME3Q13232 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NME3Q13232 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NME3Q13232 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NME3Q13232 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NME3Q13232 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NME3Q13232 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NME3Q13232 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NME3Q13232 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NME3Q13232 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NME3Q13232 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NME3Q13232 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NME3Q13232 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NME3Q13232 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NME3Q13232 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NME3Q13232 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NME3Q13232 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NME3Q13232 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NME3Q13232 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NME3Q13232 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms