Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
STRN3Q13033 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
STRN3Q13033 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRN3Q13033 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRN3Q13033 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRN3Q13033 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRN3Q13033 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRN3Q13033 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRN3Q13033 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRN3Q13033 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRN3Q13033 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRN3Q13033 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRN3Q13033 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRN3Q13033 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRN3Q13033 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRN3Q13033 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRN3Q13033 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
STRN3Q13033 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRN3Q13033 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRN3Q13033 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRN3Q13033 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRN3Q13033 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRN3Q13033 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRN3Q13033 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRN3Q13033 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRN3Q13033 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRN3Q13033 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRN3Q13033 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRN3Q13033 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRN3Q13033 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRN3Q13033 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRN3Q13033 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
STRN3Q13033 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRN3Q13033 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRN3Q13033 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRN3Q13033 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRN3Q13033 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRN3Q13033 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRN3Q13033 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRN3Q13033 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRN3Q13033 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRN3Q13033 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRN3Q13033 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRN3Q13033 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRN3Q13033 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
STRN3Q13033 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRN3Q13033 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRN3Q13033 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRN3Q13033 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
STRN3Q13033 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRN3Q13033 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRN3Q13033 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
STRN3Q13033 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRN3Q13033 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRN3Q13033 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRN3Q13033 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
STRN3Q13033 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRN3Q13033 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
STRN3Q13033 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
STRN3Q13033 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
STRN3Q13033 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms