Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
PRDM2Q13029 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
PRDM2Q13029 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC38.43■■■■□ 3.74
PRDM2Q13029 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC38.43■■■■□ 3.74
PRDM2Q13029 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
PRDM2Q13029 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
PRDM2Q13029 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
PRDM2Q13029 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
PRDM2Q13029 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
PRDM2Q13029 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
PRDM2Q13029 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
PRDM2Q13029 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
PRDM2Q13029 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC38.41■■■■□ 3.74
PRDM2Q13029 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
PRDM2Q13029 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
PRDM2Q13029 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
PRDM2Q13029 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
PRDM2Q13029 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
PRDM2Q13029 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC38.4■■■■□ 3.74
PRDM2Q13029 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
PRDM2Q13029 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
PRDM2Q13029 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC38.4■■■■□ 3.74
PRDM2Q13029 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
PRDM2Q13029 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
PRDM2Q13029 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
PRDM2Q13029 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
PRDM2Q13029 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
PRDM2Q13029 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC38.38■■■■□ 3.74
PRDM2Q13029 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.74
PRDM2Q13029 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.74
PRDM2Q13029 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
PRDM2Q13029 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
PRDM2Q13029 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
PRDM2Q13029 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
PRDM2Q13029 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
PRDM2Q13029 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
PRDM2Q13029 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
PRDM2Q13029 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
PRDM2Q13029 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC38.37■■■■□ 3.73
PRDM2Q13029 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
PRDM2Q13029 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
PRDM2Q13029 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
PRDM2Q13029 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
PRDM2Q13029 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
PRDM2Q13029 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC38.36■■■■□ 3.73
PRDM2Q13029 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
PRDM2Q13029 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
PRDM2Q13029 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
PRDM2Q13029 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
PRDM2Q13029 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
PRDM2Q13029 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC38.35■■■■□ 3.73
PRDM2Q13029 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC38.35■■■■□ 3.73
PRDM2Q13029 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
PRDM2Q13029 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
PRDM2Q13029 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
PRDM2Q13029 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
PRDM2Q13029 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
PRDM2Q13029 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
PRDM2Q13029 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
PRDM2Q13029 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
PRDM2Q13029 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
PRDM2Q13029 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
PRDM2Q13029 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.73
PRDM2Q13029 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.73
PRDM2Q13029 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
PRDM2Q13029 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC38.32■■■■□ 3.73
PRDM2Q13029 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
PRDM2Q13029 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
PRDM2Q13029 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC38.32■■■■□ 3.72
PRDM2Q13029 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
PRDM2Q13029 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
PRDM2Q13029 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.72
PRDM2Q13029 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
PRDM2Q13029 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
PRDM2Q13029 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
PRDM2Q13029 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
PRDM2Q13029 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
PRDM2Q13029 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
PRDM2Q13029 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
PRDM2Q13029 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
PRDM2Q13029 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
PRDM2Q13029 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
PRDM2Q13029 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
PRDM2Q13029 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC38.29■■■■□ 3.72
PRDM2Q13029 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
PRDM2Q13029 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
PRDM2Q13029 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
PRDM2Q13029 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
PRDM2Q13029 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
PRDM2Q13029 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
PRDM2Q13029 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
PRDM2Q13029 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
PRDM2Q13029 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
PRDM2Q13029 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
PRDM2Q13029 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
PRDM2Q13029 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
PRDM2Q13029 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC38.28■■■■□ 3.72
PRDM2Q13029 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
PRDM2Q13029 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
PRDM2Q13029 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
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