Protein–RNA interactions for Protein: Q12955

ANK3, Ankyrin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANK3Q12955 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANK3Q12955 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANK3Q12955 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANK3Q12955 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANK3Q12955 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANK3Q12955 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANK3Q12955 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANK3Q12955 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANK3Q12955 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ANK3Q12955 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANK3Q12955 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANK3Q12955 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ANK3Q12955 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANK3Q12955 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANK3Q12955 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANK3Q12955 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANK3Q12955 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANK3Q12955 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANK3Q12955 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANK3Q12955 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANK3Q12955 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANK3Q12955 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ANK3Q12955 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANK3Q12955 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANK3Q12955 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANK3Q12955 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANK3Q12955 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANK3Q12955 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANK3Q12955 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANK3Q12955 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANK3Q12955 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANK3Q12955 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANK3Q12955 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANK3Q12955 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANK3Q12955 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANK3Q12955 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANK3Q12955 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANK3Q12955 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANK3Q12955 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANK3Q12955 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANK3Q12955 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANK3Q12955 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANK3Q12955 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANK3Q12955 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANK3Q12955 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANK3Q12955 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANK3Q12955 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANK3Q12955 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANK3Q12955 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANK3Q12955 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANK3Q12955 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANK3Q12955 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANK3Q12955 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANK3Q12955 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANK3Q12955 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANK3Q12955 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANK3Q12955 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANK3Q12955 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANK3Q12955 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ANK3Q12955 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANK3Q12955 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANK3Q12955 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ANK3Q12955 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANK3Q12955 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANK3Q12955 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANK3Q12955 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ANK3Q12955 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANK3Q12955 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANK3Q12955 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANK3Q12955 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANK3Q12955 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ANK3Q12955 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANK3Q12955 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ANK3Q12955 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANK3Q12955 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ANK3Q12955 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ANK3Q12955 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANK3Q12955 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANK3Q12955 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANK3Q12955 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANK3Q12955 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANK3Q12955 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANK3Q12955 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ANK3Q12955 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ANK3Q12955 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ANK3Q12955 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ANK3Q12955 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ANK3Q12955 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ANK3Q12955 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ANK3Q12955 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ANK3Q12955 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ANK3Q12955 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ANK3Q12955 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ANK3Q12955 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ANK3Q12955 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ANK3Q12955 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ANK3Q12955 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ANK3Q12955 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ANK3Q12955 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ANK3Q12955 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms