Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNMA1Q12791 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNMA1Q12791 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNMA1Q12791 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNMA1Q12791 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNMA1Q12791 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNMA1Q12791 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNMA1Q12791 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNMA1Q12791 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNMA1Q12791 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNMA1Q12791 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNMA1Q12791 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNMA1Q12791 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNMA1Q12791 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNMA1Q12791 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNMA1Q12791 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNMA1Q12791 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNMA1Q12791 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNMA1Q12791 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNMA1Q12791 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNMA1Q12791 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNMA1Q12791 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNMA1Q12791 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNMA1Q12791 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNMA1Q12791 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNMA1Q12791 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNMA1Q12791 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNMA1Q12791 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNMA1Q12791 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNMA1Q12791 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNMA1Q12791 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KCNMA1Q12791 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNMA1Q12791 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNMA1Q12791 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNMA1Q12791 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNMA1Q12791 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KCNMA1Q12791 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNMA1Q12791 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KCNMA1Q12791 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNMA1Q12791 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNMA1Q12791 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNMA1Q12791 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNMA1Q12791 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNMA1Q12791 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNMA1Q12791 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNMA1Q12791 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNMA1Q12791 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNMA1Q12791 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNMA1Q12791 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNMA1Q12791 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNMA1Q12791 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNMA1Q12791 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNMA1Q12791 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNMA1Q12791 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNMA1Q12791 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNMA1Q12791 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNMA1Q12791 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNMA1Q12791 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNMA1Q12791 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNMA1Q12791 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNMA1Q12791 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNMA1Q12791 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNMA1Q12791 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNMA1Q12791 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNMA1Q12791 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNMA1Q12791 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNMA1Q12791 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNMA1Q12791 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNMA1Q12791 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNMA1Q12791 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNMA1Q12791 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNMA1Q12791 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNMA1Q12791 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNMA1Q12791 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNMA1Q12791 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNMA1Q12791 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNMA1Q12791 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNMA1Q12791 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
KCNMA1Q12791 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNMA1Q12791 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNMA1Q12791 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNMA1Q12791 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNMA1Q12791 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNMA1Q12791 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNMA1Q12791 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNMA1Q12791 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNMA1Q12791 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNMA1Q12791 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNMA1Q12791 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNMA1Q12791 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNMA1Q12791 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNMA1Q12791 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNMA1Q12791 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNMA1Q12791 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNMA1Q12791 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNMA1Q12791 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNMA1Q12791 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNMA1Q12791 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNMA1Q12791 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNMA1Q12791 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms