Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAPQ12770 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAPQ12770 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAPQ12770 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAPQ12770 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAPQ12770 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAPQ12770 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAPQ12770 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAPQ12770 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAPQ12770 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAPQ12770 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAPQ12770 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAPQ12770 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAPQ12770 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAPQ12770 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAPQ12770 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAPQ12770 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAPQ12770 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAPQ12770 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAPQ12770 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAPQ12770 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAPQ12770 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAPQ12770 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAPQ12770 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAPQ12770 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAPQ12770 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAPQ12770 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAPQ12770 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAPQ12770 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAPQ12770 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAPQ12770 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAPQ12770 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAPQ12770 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAPQ12770 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAPQ12770 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAPQ12770 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAPQ12770 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAPQ12770 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAPQ12770 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAPQ12770 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAPQ12770 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAPQ12770 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAPQ12770 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAPQ12770 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAPQ12770 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAPQ12770 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAPQ12770 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAPQ12770 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAPQ12770 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAPQ12770 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAPQ12770 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAPQ12770 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAPQ12770 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAPQ12770 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAPQ12770 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAPQ12770 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAPQ12770 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAPQ12770 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAPQ12770 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAPQ12770 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAPQ12770 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCAPQ12770 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCAPQ12770 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCAPQ12770 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCAPQ12770 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms