Protein–RNA interactions for Protein: Q12483

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, yeastyeast

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNF8Q12483 DEG1YFL001W 1329 nt3.88□□□□□ -1.79
SNF8Q12483 YBR138CYBR138C 1575 nt3.88□□□□□ -1.79
SNF8Q12483 IDS2YJL146W 1410 nt3.87□□□□□ -1.79
SNF8Q12483 WHI4YDL224C 1950 nt3.87□□□□□ -1.79
SNF8Q12483 SOF1YLL011W 1470 nt3.87□□□□□ -1.79
SNF8Q12483 HSP30YCR021C 999 nt3.87□□□□□ -1.79
SNF8Q12483 PHO13YDL236W 939 nt3.87□□□□□ -1.79
SNF8Q12483 AIM7YDR063W 450 nt3.87□□□□□ -1.79
SNF8Q12483 YFR045WYFR045W 930 nt3.87□□□□□ -1.79
SNF8Q12483 MIC26YGR235C 702 nt3.87□□□□□ -1.79
SNF8Q12483 YML116W-AYML116W-A 303 nt3.87□□□□□ -1.79
SNF8Q12483 SIW14YNL032W 846 nt3.87□□□□□ -1.79
SNF8Q12483 RPL18BYNL301C 561 nt3.87□□□□□ -1.79
SNF8Q12483 RDH54YBR073W 2877 nt3.87□□□□□ -1.79
SNF8Q12483 PTR3YFR029W 2037 nt3.87□□□□□ -1.79
SNF8Q12483 TRS85YDR108W 2097 nt3.86□□□□□ -1.79
SNF8Q12483 KIN2YLR096W 3444 nt3.86□□□□□ -1.79
SNF8Q12483 BCK2YER167W 2556 nt3.86□□□□□ -1.79
SNF8Q12483 ALR2YFL050C 2577 nt3.86□□□□□ -1.79
SNF8Q12483 ULS1YOR191W 4860 nt3.86□□□□□ -1.79
SNF8Q12483 BIO2YGR286C 1128 nt3.86□□□□□ -1.79
SNF8Q12483 SHE1YBL031W 1017 nt3.86□□□□□ -1.79
SNF8Q12483 OSH2YDL019C 3852 nt3.86□□□□□ -1.79
SNF8Q12483 SPC105YGL093W 2754 nt3.86□□□□□ -1.79
SNF8Q12483 SET4YJL105W 1683 nt3.86□□□□□ -1.79
SNF8Q12483 NAM2YLR382C 2685 nt3.86□□□□□ -1.79
SNF8Q12483 FLC1YPL221W 2382 nt3.85□□□□□ -1.79
SNF8Q12483 ALG9YNL219C 1668 nt3.85□□□□□ -1.79
SNF8Q12483 YGL199CYGL199C 471 nt3.85□□□□□ -1.79
SNF8Q12483 YAE1YJR067C 426 nt3.85□□□□□ -1.79
SNF8Q12483 PER33YLR064W 822 nt3.85□□□□□ -1.79
SNF8Q12483 PEP4YPL154C 1218 nt3.85□□□□□ -1.79
SNF8Q12483 ISA2YPR067W 558 nt3.85□□□□□ -1.79
SNF8Q12483 snR37snR37 386 nt3.85□□□□□ -1.79
SNF8Q12483 STP22YCL008C 1158 nt3.85□□□□□ -1.79
SNF8Q12483 NOC2YOR206W 2133 nt3.85□□□□□ -1.79
SNF8Q12483 ATG32YIL146C 1590 nt3.85□□□□□ -1.79
SNF8Q12483 BOI2YER114C 3123 nt3.84□□□□□ -1.79
SNF8Q12483 NHX1YDR456W 1902 nt3.84□□□□□ -1.79
SNF8Q12483 RPB2YOR151C 3675 nt3.84□□□□□ -1.79
SNF8Q12483 YGL088WYGL088W 366 nt3.84□□□□□ -1.79
SNF8Q12483 YGR079WYGR079W 1113 nt3.84□□□□□ -1.79
SNF8Q12483 FSH3YOR280C 801 nt3.84□□□□□ -1.79
SNF8Q12483 FAA1YOR317W 2103 nt3.84□□□□□ -1.79
SNF8Q12483 NCR1YPL006W 3513 nt3.84□□□□□ -1.8
SNF8Q12483 STB3YDR169C 1542 nt3.84□□□□□ -1.8
SNF8Q12483 UBP6YFR010W 1500 nt3.84□□□□□ -1.8
SNF8Q12483 UGA3YDL170W 1587 nt3.84□□□□□ -1.8
SNF8Q12483 GAS2YLR343W 1668 nt3.84□□□□□ -1.8
SNF8Q12483 HMG1YML075C 3165 nt3.83□□□□□ -1.8
SNF8Q12483 CAF16YFL028C 870 nt3.83□□□□□ -1.8
SNF8Q12483 YGL262WYGL262W 528 nt3.83□□□□□ -1.8
SNF8Q12483 GVP36YIL041W 981 nt3.83□□□□□ -1.8
SNF8Q12483 SWC7YLR385C 399 nt3.83□□□□□ -1.8
SNF8Q12483 YPL077CYPL077C 723 nt3.83□□□□□ -1.8
SNF8Q12483 YBR056W-AYBR056W-A 201 nt3.83□□□□□ -1.8
SNF8Q12483 GDT1YBR187W 843 nt3.83□□□□□ -1.8
SNF8Q12483 SEC2YNL272C 2280 nt3.83□□□□□ -1.8
SNF8Q12483 SYF1YDR416W 2580 nt3.83□□□□□ -1.8
SNF8Q12483 CHL1YPL008W 2586 nt3.82□□□□□ -1.8
SNF8Q12483 BCH2YKR027W 2298 nt3.82□□□□□ -1.8
SNF8Q12483 FKH1YIL131C 1455 nt3.82□□□□□ -1.8
SNF8Q12483 YEL028WYEL028W 462 nt3.82□□□□□ -1.8
SNF8Q12483 DSD1YGL196W 1287 nt3.82□□□□□ -1.8
SNF8Q12483 SPO12YHR152W 522 nt3.82□□□□□ -1.8
SNF8Q12483 YJR038CYJR038C 363 nt3.82□□□□□ -1.8
SNF8Q12483 SRP40YKR092C 1221 nt3.82□□□□□ -1.8
SNF8Q12483 YLR122CYLR122C 378 nt3.82□□□□□ -1.8
SNF8Q12483 MRPL3YMR024W 1173 nt3.82□□□□□ -1.8
SNF8Q12483 SLX1YBR228W 915 nt3.82□□□□□ -1.8
SNF8Q12483 VMA1YDL185W 3216 nt3.82□□□□□ -1.8
SNF8Q12483 SWP82YFL049W 1872 nt3.81□□□□□ -1.8
SNF8Q12483 GRS2YPR081C 1857 nt3.81□□□□□ -1.8
SNF8Q12483 VPS36YLR417W 1701 nt3.81□□□□□ -1.8
SNF8Q12483 RAD1YPL022W 3303 nt3.81□□□□□ -1.8
SNF8Q12483 ACE2YLR131C 2313 nt3.81□□□□□ -1.8
SNF8Q12483 HSP42YDR171W 1128 nt3.81□□□□□ -1.8
SNF8Q12483 YGL188CYGL188C 174 nt3.81□□□□□ -1.8
SNF8Q12483 YGL193CYGL193C 312 nt3.81□□□□□ -1.8
SNF8Q12483 ECM34YHL043W 513 nt3.81□□□□□ -1.8
SNF8Q12483 YLR157W-DYLR157W-D 213 nt3.81□□□□□ -1.8
SNF8Q12483 MRPL24YMR193W 777 nt3.81□□□□□ -1.8
SNF8Q12483 YBR134WYBR134W 402 nt3.81□□□□□ -1.8
SNF8Q12483 VHS3YOR054C 2025 nt3.8□□□□□ -1.8
SNF8Q12483 YMR111CYMR111C 1389 nt3.8□□□□□ -1.8
SNF8Q12483 YDL228CYDL228C 642 nt3.8□□□□□ -1.8
SNF8Q12483 RPS13YDR064W 456 nt3.8□□□□□ -1.8
SNF8Q12483 VMA22YHR060W 546 nt3.8□□□□□ -1.8
SNF8Q12483 YLL017WYLL017W 312 nt3.8□□□□□ -1.8
SNF8Q12483 SPT23YKL020C 3249 nt3.8□□□□□ -1.8
SNF8Q12483 TAF7YMR227C 1773 nt3.79□□□□□ -1.8
SNF8Q12483 MET17YLR303W 1335 nt3.79□□□□□ -1.8
SNF8Q12483 RPS4BYHR203C 786 nt3.79□□□□□ -1.8
SNF8Q12483 RPS4AYJR145C 786 nt3.79□□□□□ -1.8
SNF8Q12483 SNO1YMR095C 675 nt3.79□□□□□ -1.8
SNF8Q12483 YBL059WYBL059W 582 nt3.79□□□□□ -1.8
SNF8Q12483 YNR061CYNR061C 660 nt3.79□□□□□ -1.8
SNF8Q12483 YOL079WYOL079W 399 nt3.79□□□□□ -1.8
SNF8Q12483 FRT2YAL028W 1587 nt3.79□□□□□ -1.8
SNF8Q12483 PHO87YCR037C 2772 nt3.79□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.1 ms