Protein–RNA interactions for Protein: Q12230

LSP1, Sphingolipid long chain base-responsive protein LSP1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSP1Q12230 YIL014C-AYIL014C-A 315 nt4.63□□□□□ -1.67
LSP1Q12230 HIS6YIL020C 786 nt4.63□□□□□ -1.67
LSP1Q12230 SOP4YJL192C 705 nt4.63□□□□□ -1.67
LSP1Q12230 ACP1YKL192C 378 nt4.63□□□□□ -1.67
LSP1Q12230 RPS31YLR167W 459 nt4.63□□□□□ -1.67
LSP1Q12230 YLR374CYLR374C 390 nt4.63□□□□□ -1.67
LSP1Q12230 YNL296WYNL296W 315 nt4.63□□□□□ -1.67
LSP1Q12230 ISA2YPR067W 558 nt4.63□□□□□ -1.67
LSP1Q12230 ZRC1YMR243C 1329 nt4.63□□□□□ -1.67
LSP1Q12230 YML020WYML020W 1995 nt4.62□□□□□ -1.67
LSP1Q12230 TRM8YDL201W 861 nt4.62□□□□□ -1.67
LSP1Q12230 YGL101WYGL101W 648 nt4.62□□□□□ -1.67
LSP1Q12230 SPO16YHR153C 597 nt4.62□□□□□ -1.67
LSP1Q12230 IRC9YJL142C 393 nt4.62□□□□□ -1.67
LSP1Q12230 YNG1YOR064C 660 nt4.62□□□□□ -1.67
LSP1Q12230 RMI1YPL024W 726 nt4.62□□□□□ -1.67
LSP1Q12230 SMF1YOL122C 1728 nt4.62□□□□□ -1.67
LSP1Q12230 IBA57YJR122W 1494 nt4.62□□□□□ -1.67
LSP1Q12230 MTR10YOR160W 2919 nt4.61□□□□□ -1.67
LSP1Q12230 YDR249CYDR249C 1122 nt4.61□□□□□ -1.67
LSP1Q12230 YDR445CYDR445C 408 nt4.61□□□□□ -1.67
LSP1Q12230 DUO1YGL061C 744 nt4.61□□□□□ -1.67
LSP1Q12230 YGR273CYGR273C 525 nt4.61□□□□□ -1.67
LSP1Q12230 WSS1YHR134W 810 nt4.61□□□□□ -1.67
LSP1Q12230 RRN9YMR270C 1098 nt4.61□□□□□ -1.67
LSP1Q12230 FAS2YPL231W 5664 nt4.6□□□□□ -1.67
LSP1Q12230 NTH1YDR001C 2256 nt4.6□□□□□ -1.67
LSP1Q12230 TCO89YPL180W 2400 nt4.6□□□□□ -1.67
LSP1Q12230 YER034WYER034W 558 nt4.6□□□□□ -1.67
LSP1Q12230 DSD1YGL196W 1287 nt4.6□□□□□ -1.67
LSP1Q12230 SRB5YGR104C 924 nt4.6□□□□□ -1.67
LSP1Q12230 ATP12YJL180C 978 nt4.6□□□□□ -1.67
LSP1Q12230 SAF1YBR280C 1914 nt4.6□□□□□ -1.67
LSP1Q12230 ADP1YCR011C 3150 nt4.59□□□□□ -1.67
LSP1Q12230 MOB2YFL034C-B 864 nt4.59□□□□□ -1.67
LSP1Q12230 ARD1YHR013C 717 nt4.59□□□□□ -1.67
LSP1Q12230 TDA11YHR159W 1515 nt4.59□□□□□ -1.67
LSP1Q12230 AVT7YIL088C 1473 nt4.59□□□□□ -1.67
LSP1Q12230 MHO1YJR008W 1017 nt4.59□□□□□ -1.67
LSP1Q12230 OMA1YKR087C 1038 nt4.59□□□□□ -1.67
LSP1Q12230 YBL036CYBL036C 774 nt4.59□□□□□ -1.67
LSP1Q12230 APC1YNL172W 5247 nt4.59□□□□□ -1.67
LSP1Q12230 FAT1YBR041W 2010 nt4.59□□□□□ -1.67
LSP1Q12230 FLC1YPL221W 2382 nt4.59□□□□□ -1.67
LSP1Q12230 SUI3YPL237W 858 nt4.59□□□□□ -1.67
LSP1Q12230 SLX1YBR228W 915 nt4.59□□□□□ -1.67
LSP1Q12230 ADY3YDL239C 2373 nt4.58□□□□□ -1.68
LSP1Q12230 RMD1YDL001W 1293 nt4.58□□□□□ -1.68
LSP1Q12230 REC104YHR157W 549 nt4.58□□□□□ -1.68
LSP1Q12230 YNK1YKL067W 462 nt4.58□□□□□ -1.68
LSP1Q12230 YLR154W-BYLR154W-B 165 nt4.58□□□□□ -1.68
LSP1Q12230 RPL15BYMR121C 615 nt4.58□□□□□ -1.68
LSP1Q12230 ROT1YMR200W 771 nt4.58□□□□□ -1.68
LSP1Q12230 YBR141W-AYBR141W-A 96 nt4.58□□□□□ -1.68
LSP1Q12230 ARO9YHR137W 1542 nt4.57□□□□□ -1.68
LSP1Q12230 DEG1YFL001W 1329 nt4.57□□□□□ -1.68
LSP1Q12230 SPT23YKL020C 3249 nt4.57□□□□□ -1.68
LSP1Q12230 YPR174CYPR174C 666 nt4.57□□□□□ -1.68
LSP1Q12230 TAF7YMR227C 1773 nt4.57□□□□□ -1.68
LSP1Q12230 MKS1YNL076W 1755 nt4.57□□□□□ -1.68
LSP1Q12230 PPZ1YML016C 2079 nt4.57□□□□□ -1.68
LSP1Q12230 HSP30YCR021C 999 nt4.56□□□□□ -1.68
LSP1Q12230 snR78snR78 87 nt4.56□□□□□ -1.68
LSP1Q12230 CAF16YFL028C 870 nt4.56□□□□□ -1.68
LSP1Q12230 YFR034W-AYFR034W-A 288 nt4.56□□□□□ -1.68
LSP1Q12230 GON7YJL184W 372 nt4.56□□□□□ -1.68
LSP1Q12230 YLR364C-AYLR364C-A 123 nt4.56□□□□□ -1.68
LSP1Q12230 TIF34YMR146C 1044 nt4.56□□□□□ -1.68
LSP1Q12230 PFA4YOL003C 1137 nt4.56□□□□□ -1.68
LSP1Q12230 NRG2YBR066C 663 nt4.56□□□□□ -1.68
LSP1Q12230 YBR196C-BYBR196C-B 105 nt4.56□□□□□ -1.68
LSP1Q12230 ARO80YDR421W 2853 nt4.56□□□□□ -1.68
LSP1Q12230 GAC1YOR178C 2382 nt4.56□□□□□ -1.68
LSP1Q12230 ECM16YMR128W 3804 nt4.56□□□□□ -1.68
LSP1Q12230 YHR177WYHR177W 1362 nt4.55□□□□□ -1.68
LSP1Q12230 YMR111CYMR111C 1389 nt4.55□□□□□ -1.68
LSP1Q12230 OSH2YDL019C 3852 nt4.55□□□□□ -1.68
LSP1Q12230 HOM2YDR158W 1098 nt4.55□□□□□ -1.68
LSP1Q12230 YDR230WYDR230W 348 nt4.55□□□□□ -1.68
LSP1Q12230 YDR246W-AYDR246W-A 201 nt4.55□□□□□ -1.68
LSP1Q12230 RRP45YDR280W 918 nt4.55□□□□□ -1.68
LSP1Q12230 YHL045WYHL045W 348 nt4.55□□□□□ -1.68
LSP1Q12230 RPB3YIL021W 957 nt4.55□□□□□ -1.68
LSP1Q12230 YAR023CYAR023C 540 nt4.55□□□□□ -1.68
LSP1Q12230 SNO1YMR095C 675 nt4.55□□□□□ -1.68
LSP1Q12230 YIM2YMR151W 438 nt4.55□□□□□ -1.68
LSP1Q12230 NIS1YNL078W 1224 nt4.55□□□□□ -1.68
LSP1Q12230 YBR225WYBR225W 2703 nt4.55□□□□□ -1.68
LSP1Q12230 SWH1YAR042W 3567 nt4.54□□□□□ -1.68
LSP1Q12230 RAD26YJR035W 3258 nt4.54□□□□□ -1.68
LSP1Q12230 GRS2YPR081C 1857 nt4.54□□□□□ -1.68
LSP1Q12230 TIP20YGL145W 2106 nt4.54□□□□□ -1.68
LSP1Q12230 YIL047C-AYIL047C-A 369 nt4.54□□□□□ -1.68
LSP1Q12230 RPP0YLR340W 939 nt4.54□□□□□ -1.68
LSP1Q12230 HRT1YOL133W 366 nt4.54□□□□□ -1.68
LSP1Q12230 YOR131CYOR131C 657 nt4.54□□□□□ -1.68
LSP1Q12230 PNG1YPL096W 1092 nt4.54□□□□□ -1.68
LSP1Q12230 YPR015CYPR015C 744 nt4.54□□□□□ -1.68
LSP1Q12230 FYV5YCL058C 459 nt4.54□□□□□ -1.68
LSP1Q12230 SEC2YNL272C 2280 nt4.54□□□□□ -1.68
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