Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC15Q0P6D6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC15Q0P6D6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC15Q0P6D6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC15Q0P6D6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC15Q0P6D6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC15Q0P6D6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC15Q0P6D6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC15Q0P6D6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC15Q0P6D6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC15Q0P6D6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC15Q0P6D6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC15Q0P6D6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC15Q0P6D6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC15Q0P6D6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC15Q0P6D6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC15Q0P6D6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC15Q0P6D6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC15Q0P6D6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC15Q0P6D6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC15Q0P6D6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC15Q0P6D6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC15Q0P6D6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC15Q0P6D6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC15Q0P6D6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC15Q0P6D6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC15Q0P6D6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC15Q0P6D6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC15Q0P6D6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC15Q0P6D6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC15Q0P6D6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC15Q0P6D6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC15Q0P6D6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC15Q0P6D6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC15Q0P6D6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC15Q0P6D6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC15Q0P6D6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC15Q0P6D6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC15Q0P6D6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC15Q0P6D6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC15Q0P6D6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC15Q0P6D6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC15Q0P6D6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC15Q0P6D6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC15Q0P6D6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC15Q0P6D6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC15Q0P6D6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC15Q0P6D6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC15Q0P6D6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC15Q0P6D6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC15Q0P6D6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC15Q0P6D6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC15Q0P6D6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC15Q0P6D6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC15Q0P6D6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC15Q0P6D6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC15Q0P6D6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC15Q0P6D6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC15Q0P6D6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms