Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFFO1Q0D2I5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFFO1Q0D2I5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFFO1Q0D2I5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFFO1Q0D2I5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFFO1Q0D2I5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFFO1Q0D2I5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFFO1Q0D2I5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFFO1Q0D2I5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFFO1Q0D2I5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFFO1Q0D2I5 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFFO1Q0D2I5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFFO1Q0D2I5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFFO1Q0D2I5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFFO1Q0D2I5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFFO1Q0D2I5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFFO1Q0D2I5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFFO1Q0D2I5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFFO1Q0D2I5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFFO1Q0D2I5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
IFFO1Q0D2I5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFFO1Q0D2I5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFFO1Q0D2I5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFFO1Q0D2I5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFFO1Q0D2I5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFFO1Q0D2I5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFFO1Q0D2I5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFFO1Q0D2I5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFFO1Q0D2I5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFFO1Q0D2I5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFFO1Q0D2I5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFFO1Q0D2I5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFFO1Q0D2I5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFFO1Q0D2I5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFFO1Q0D2I5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFFO1Q0D2I5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
IFFO1Q0D2I5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFFO1Q0D2I5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFFO1Q0D2I5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFFO1Q0D2I5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFFO1Q0D2I5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFFO1Q0D2I5 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFFO1Q0D2I5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFFO1Q0D2I5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFFO1Q0D2I5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IFFO1Q0D2I5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFFO1Q0D2I5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFFO1Q0D2I5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFFO1Q0D2I5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFFO1Q0D2I5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFFO1Q0D2I5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFFO1Q0D2I5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFFO1Q0D2I5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFFO1Q0D2I5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFFO1Q0D2I5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFFO1Q0D2I5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFFO1Q0D2I5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFFO1Q0D2I5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFFO1Q0D2I5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
IFFO1Q0D2I5 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFFO1Q0D2I5 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFFO1Q0D2I5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFFO1Q0D2I5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFFO1Q0D2I5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFFO1Q0D2I5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFFO1Q0D2I5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFFO1Q0D2I5 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFFO1Q0D2I5 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFFO1Q0D2I5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFFO1Q0D2I5 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
IFFO1Q0D2I5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
IFFO1Q0D2I5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFFO1Q0D2I5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFFO1Q0D2I5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFFO1Q0D2I5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFFO1Q0D2I5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFFO1Q0D2I5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFFO1Q0D2I5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFFO1Q0D2I5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFFO1Q0D2I5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFFO1Q0D2I5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFFO1Q0D2I5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFFO1Q0D2I5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFFO1Q0D2I5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFFO1Q0D2I5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFFO1Q0D2I5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFFO1Q0D2I5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFFO1Q0D2I5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFFO1Q0D2I5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFFO1Q0D2I5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
IFFO1Q0D2I5 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFFO1Q0D2I5 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFFO1Q0D2I5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFFO1Q0D2I5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFFO1Q0D2I5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFFO1Q0D2I5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFFO1Q0D2I5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFFO1Q0D2I5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
IFFO1Q0D2I5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFFO1Q0D2I5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms