Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDR1Q08345 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDR1Q08345 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
DDR1Q08345 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
DDR1Q08345 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
DDR1Q08345 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DDR1Q08345 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DDR1Q08345 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DDR1Q08345 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
DDR1Q08345 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DDR1Q08345 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDR1Q08345 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDR1Q08345 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDR1Q08345 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDR1Q08345 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDR1Q08345 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDR1Q08345 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDR1Q08345 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDR1Q08345 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDR1Q08345 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDR1Q08345 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDR1Q08345 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDR1Q08345 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDR1Q08345 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDR1Q08345 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDR1Q08345 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDR1Q08345 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDR1Q08345 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDR1Q08345 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDR1Q08345 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDR1Q08345 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDR1Q08345 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDR1Q08345 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDR1Q08345 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDR1Q08345 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDR1Q08345 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDR1Q08345 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDR1Q08345 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDR1Q08345 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDR1Q08345 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDR1Q08345 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDR1Q08345 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDR1Q08345 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDR1Q08345 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
DDR1Q08345 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDR1Q08345 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDR1Q08345 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
DDR1Q08345 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDR1Q08345 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDR1Q08345 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDR1Q08345 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDR1Q08345 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDR1Q08345 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDR1Q08345 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDR1Q08345 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDR1Q08345 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDR1Q08345 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDR1Q08345 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
DDR1Q08345 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDR1Q08345 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
DDR1Q08345 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
DDR1Q08345 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
DDR1Q08345 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDR1Q08345 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDR1Q08345 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDR1Q08345 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
DDR1Q08345 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDR1Q08345 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDR1Q08345 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDR1Q08345 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDR1Q08345 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDR1Q08345 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDR1Q08345 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDR1Q08345 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDR1Q08345 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDR1Q08345 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDR1Q08345 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDR1Q08345 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDR1Q08345 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDR1Q08345 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
DDR1Q08345 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDR1Q08345 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDR1Q08345 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDR1Q08345 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
DDR1Q08345 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDR1Q08345 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDR1Q08345 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDR1Q08345 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDR1Q08345 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDR1Q08345 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDR1Q08345 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDR1Q08345 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDR1Q08345 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDR1Q08345 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDR1Q08345 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDR1Q08345 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
DDR1Q08345 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDR1Q08345 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDR1Q08345 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDR1Q08345 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms