Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DHX9Q08211 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DHX9Q08211 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DHX9Q08211 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DHX9Q08211 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DHX9Q08211 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DHX9Q08211 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DHX9Q08211 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DHX9Q08211 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DHX9Q08211 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DHX9Q08211 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DHX9Q08211 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DHX9Q08211 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DHX9Q08211 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DHX9Q08211 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DHX9Q08211 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DHX9Q08211 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DHX9Q08211 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DHX9Q08211 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DHX9Q08211 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DHX9Q08211 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DHX9Q08211 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DHX9Q08211 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DHX9Q08211 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DHX9Q08211 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DHX9Q08211 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DHX9Q08211 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DHX9Q08211 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DHX9Q08211 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DHX9Q08211 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DHX9Q08211 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DHX9Q08211 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DHX9Q08211 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DHX9Q08211 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DHX9Q08211 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DHX9Q08211 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DHX9Q08211 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DHX9Q08211 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DHX9Q08211 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DHX9Q08211 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DHX9Q08211 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DHX9Q08211 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DHX9Q08211 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DHX9Q08211 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DHX9Q08211 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DHX9Q08211 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DHX9Q08211 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DHX9Q08211 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DHX9Q08211 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DHX9Q08211 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DHX9Q08211 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DHX9Q08211 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DHX9Q08211 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DHX9Q08211 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DHX9Q08211 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DHX9Q08211 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DHX9Q08211 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DHX9Q08211 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DHX9Q08211 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DHX9Q08211 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DHX9Q08211 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DHX9Q08211 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DHX9Q08211 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DHX9Q08211 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DHX9Q08211 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DHX9Q08211 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
DHX9Q08211 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DHX9Q08211 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DHX9Q08211 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DHX9Q08211 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DHX9Q08211 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DHX9Q08211 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DHX9Q08211 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DHX9Q08211 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DHX9Q08211 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DHX9Q08211 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms