Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LRP1Q07954 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LRP1Q07954 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LRP1Q07954 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LRP1Q07954 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
LRP1Q07954 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LRP1Q07954 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LRP1Q07954 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LRP1Q07954 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LRP1Q07954 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LRP1Q07954 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LRP1Q07954 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LRP1Q07954 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
LRP1Q07954 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LRP1Q07954 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LRP1Q07954 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LRP1Q07954 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LRP1Q07954 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LRP1Q07954 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
LRP1Q07954 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LRP1Q07954 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LRP1Q07954 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LRP1Q07954 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LRP1Q07954 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LRP1Q07954 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LRP1Q07954 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LRP1Q07954 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LRP1Q07954 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LRP1Q07954 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LRP1Q07954 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LRP1Q07954 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LRP1Q07954 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LRP1Q07954 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LRP1Q07954 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LRP1Q07954 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LRP1Q07954 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LRP1Q07954 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LRP1Q07954 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LRP1Q07954 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LRP1Q07954 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LRP1Q07954 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LRP1Q07954 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LRP1Q07954 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
LRP1Q07954 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
LRP1Q07954 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
LRP1Q07954 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
LRP1Q07954 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
LRP1Q07954 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
LRP1Q07954 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
LRP1Q07954 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
LRP1Q07954 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
LRP1Q07954 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
LRP1Q07954 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
LRP1Q07954 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LRP1Q07954 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LRP1Q07954 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LRP1Q07954 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LRP1Q07954 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LRP1Q07954 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LRP1Q07954 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LRP1Q07954 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LRP1Q07954 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
LRP1Q07954 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LRP1Q07954 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LRP1Q07954 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LRP1Q07954 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LRP1Q07954 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LRP1Q07954 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LRP1Q07954 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LRP1Q07954 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LRP1Q07954 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LRP1Q07954 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LRP1Q07954 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LRP1Q07954 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LRP1Q07954 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LRP1Q07954 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LRP1Q07954 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
LRP1Q07954 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LRP1Q07954 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LRP1Q07954 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LRP1Q07954 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LRP1Q07954 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LRP1Q07954 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LRP1Q07954 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LRP1Q07954 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LRP1Q07954 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LRP1Q07954 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LRP1Q07954 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LRP1Q07954 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LRP1Q07954 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LRP1Q07954 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LRP1Q07954 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LRP1Q07954 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LRP1Q07954 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LRP1Q07954 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LRP1Q07954 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LRP1Q07954 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LRP1Q07954 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LRP1Q07954 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LRP1Q07954 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms