Protein–RNA interactions for Protein: Q07912

TNK2, Activated CDC42 kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNK2Q07912 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNK2Q07912 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms