Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms